国防科技大学学报
國防科技大學學報
국방과기대학학보
JOURNAL OF NATIONAL UNIVERSITY OF DEFENSE TECHNOLOGY
2006年
4期
37-42
,共6页
王正志%李稚锋%杭兴宜%毛逸清%骆志刚%赵东升%张成岗
王正誌%李稚鋒%杭興宜%毛逸清%駱誌剛%趙東升%張成崗
왕정지%리치봉%항흥의%모일청%락지강%조동승%장성강
转录组%EST聚类%EST装配%可变剪接%高性能计算
轉錄組%EST聚類%EST裝配%可變剪接%高性能計算
전록조%EST취류%EST장배%가변전접%고성능계산
规模化基因表达实验所产生的大量与生物组织特定时空状态相关的cDNA和表达序列标签(EST)等信息可用于新基因的发现、基因表达模式分析和基因组的注释,从而可为转录组研究提供实验设计和结果分析的参考标准.真核基因可变剪接的普遍性及其在机体生理与病理过程中的重要作用,使得可变剪接的系统分析已成为功能基因组研究中的热点之一.在面临海量表达数据的指数增长和不断有新的基因组获得测序的情况下,实现转录组序列分析的规模化、自动化计算迫在眉睫.讨论不同转录组分析系统中的数据分析算法及其计算需求,并提出适用于大规模可变剪接分析的策略.
規模化基因錶達實驗所產生的大量與生物組織特定時空狀態相關的cDNA和錶達序列標籤(EST)等信息可用于新基因的髮現、基因錶達模式分析和基因組的註釋,從而可為轉錄組研究提供實驗設計和結果分析的參攷標準.真覈基因可變剪接的普遍性及其在機體生理與病理過程中的重要作用,使得可變剪接的繫統分析已成為功能基因組研究中的熱點之一.在麵臨海量錶達數據的指數增長和不斷有新的基因組穫得測序的情況下,實現轉錄組序列分析的規模化、自動化計算迫在眉睫.討論不同轉錄組分析繫統中的數據分析算法及其計算需求,併提齣適用于大規模可變剪接分析的策略.
규모화기인표체실험소산생적대량여생물조직특정시공상태상관적cDNA화표체서렬표첨(EST)등신식가용우신기인적발현、기인표체모식분석화기인조적주석,종이가위전록조연구제공실험설계화결과분석적삼고표준.진핵기인가변전접적보편성급기재궤체생리여병리과정중적중요작용,사득가변전접적계통분석이성위공능기인조연구중적열점지일.재면림해량표체수거적지수증장화불단유신적기인조획득측서적정황하,실현전록조서렬분석적규모화、자동화계산박재미첩.토론불동전록조분석계통중적수거분석산법급기계산수구,병제출괄용우대규모가변전접분석적책략.
