CAJ | 학술논문

凝集素是一种糖专一性结合蛋白,它可以识别不同的糖类.植物凝集素是植物防御系统重要的组成部分.本研究采用RT-PCR的方法,从中国水仙花蕾中克隆了凝集素基因NTA,运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析以及对其蛋白结构进行预测.结果表明,得到的NTA基因全长698 bp,包含一个完整的开放阅读框516bp.该基因编码一个含有172个氨基酸的凝集素前体蛋白,该前体蛋白的等电点和分子量分别为5.84和18 615.19 Da.序列比对结果表明该基因编码的蛋白与其他单子叶植物如杂种水仙、雪花莲、君子兰、石蒜花和孤挺花的凝集素蛋白的同源性较高,分别为84%、80%、77%、78%以及82%.蛋白结构预测表明,中国水仙凝集素蛋白与洋水仙凝集素蛋白在结构上非常相似.对该基因编码的蛋白进行分析及蛋白结构模拟可知,该蛋白含有三个特殊的功能结构域和alpha-D卜甘露糖结合表面(QXDXNXVXY).
응집소시일충당전일성결합단백,타가이식별불동적당류.식물응집소시식물방어계통중요적조성부분.본연구채용RT-PCR적방법,종중국수선화뢰중극륭료응집소기인NTA,운용생물신식학방법대기핵감산서렬、편마적안기산서렬진행분석이급대기단백결구진행예측.결과표명,득도적NTA기인전장698 bp,포함일개완정적개방열독광516bp.해기인편마일개함유172개안기산적응집소전체단백,해전체단백적등전점화분자량분별위5.84화18 615.19 Da.서렬비대결과표명해기인편마적단백여기타단자협식물여잡충수선、설화련、군자란、석산화화고정화적응집소단백적동원성교고,분별위84%、80%、77%、78%이급82%.단백결구예측표명,중국수선응집소단백여양수선응집소단백재결구상비상상사.대해기인편마적단백진행분석급단백결구모의가지,해단백함유삼개특수적공능결구역화alpha-D복감로당결합표면(QXDXNXVXY).