内蒙古农业大学学报（自然科学版）
內矇古農業大學學報（自然科學版）
내몽고농업대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF INNER MONGOLIA AGRICULTURAL UNIIVERSITY
2012年
2期
1-6
,共6页
党娟%霍金山%何建文%关平原
黨娟%霍金山%何建文%關平原
당연%곽금산%하건문%관평원
禽呼肠孤病毒%S4基因%克隆%列分析
禽呼腸孤病毒%S4基因%剋隆%列分析
금호장고병독%S4기인%극륭%렬분석
参考GenBank中禽呼肠孤病毒176株(ARV 176)S4基因序列设计两对引物,分别提取禽呼肠孤病毒T-98和C -98分离株病毒总RNA,应用RT - PCR技术扩增病毒的S4基因,将纯化的目的DNA与pEASY - T1载体连接、转化后测序.应用计算机软件将所测定序列与参考毒株序列进行比较,结果显示,S4基因核苷酸序列长为1 192bp,均含1个完整的开放性阅读框(24-1 127).ARV T - 98和ARV C - 98分离株S4基因的核苷酸同源性很高,为99.9％；与参考毒株ARV 1733、ARV S1133、ARV 750505、ARV 601SI、ARV 919、ARV T6、ARV OS161和DRV YJL S4基因的核苷酸同源性均较高,在99.4％ -99.9％之间；与ARV 601G、ARV 1017 -1、ARV 916、ARV 918和DRV S14S4基因的核苷酸同源性在80.1％ -83.6％之间；与NBV、BRV和MRV 3的S4基因核苷酸同源性在2.4％-53.1％之间.进化树分析显示:11株禽呼肠孤病毒分离株和ARVT - 98、C -98分离株的S4基因可分成3个不同的系谱.
參攷GenBank中禽呼腸孤病毒176株(ARV 176)S4基因序列設計兩對引物,分彆提取禽呼腸孤病毒T-98和C -98分離株病毒總RNA,應用RT - PCR技術擴增病毒的S4基因,將純化的目的DNA與pEASY - T1載體連接、轉化後測序.應用計算機軟件將所測定序列與參攷毒株序列進行比較,結果顯示,S4基因覈苷痠序列長為1 192bp,均含1箇完整的開放性閱讀框(24-1 127).ARV T - 98和ARV C - 98分離株S4基因的覈苷痠同源性很高,為99.9％；與參攷毒株ARV 1733、ARV S1133、ARV 750505、ARV 601SI、ARV 919、ARV T6、ARV OS161和DRV YJL S4基因的覈苷痠同源性均較高,在99.4％ -99.9％之間；與ARV 601G、ARV 1017 -1、ARV 916、ARV 918和DRV S14S4基因的覈苷痠同源性在80.1％ -83.6％之間；與NBV、BRV和MRV 3的S4基因覈苷痠同源性在2.4％-53.1％之間.進化樹分析顯示:11株禽呼腸孤病毒分離株和ARVT - 98、C -98分離株的S4基因可分成3箇不同的繫譜.
삼고GenBank중금호장고병독176주(ARV 176)S4기인서렬설계량대인물,분별제취금호장고병독T-98화C -98분리주병독총RNA,응용RT - PCR기술확증병독적S4기인,장순화적목적DNA여pEASY - T1재체련접、전화후측서.응용계산궤연건장소측정서렬여삼고독주서렬진행비교,결과현시,S4기인핵감산서렬장위1 192bp,균함1개완정적개방성열독광(24-1 127).ARV T - 98화ARV C - 98분리주S4기인적핵감산동원성흔고,위99.9％；여삼고독주ARV 1733、ARV S1133、ARV 750505、ARV 601SI、ARV 919、ARV T6、ARV OS161화DRV YJL S4기인적핵감산동원성균교고,재99.4％ -99.9％지간；여ARV 601G、ARV 1017 -1、ARV 916、ARV 918화DRV S14S4기인적핵감산동원성재80.1％ -83.6％지간；여NBV、BRV화MRV 3적S4기인핵감산동원성재2.4％-53.1％지간.진화수분석현시:11주금호장고병독분리주화ARVT - 98、C -98분리주적S4기인가분성3개불동적계보.
