高等学校化学学报
高等學校化學學報
고등학교화학학보
CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES
2008年
12期
2398-2402
,共5页
楚慧郢%郑清川%赵勇山%张红星
楚慧郢%鄭清川%趙勇山%張紅星
초혜영%정청천%조용산%장홍성
2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶%分子动力学模拟%分子对接%同源模建
2-氨基3-羧基粘康痠6-半醛脫羧酶%分子動力學模擬%分子對接%同源模建
2-안기3-최기점강산6-반철탈최매%분자동역학모의%분자대접%동원모건
利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(hACMSD)的三维结构,并利用Prufile-3D和Procheck等方法评估了模型的可靠性.在此慕础上,用分子对接程序(Affinity),将其底物2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛(ACMS)和抑制剂喹啉酸(QA)分别与hACMSD进行对接,获得了复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了底物和抑制剂的具体结合方式,明确了hACMSD与底物和抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基.
利用同源模建和分子動力學模擬方法構建瞭人類2-氨基3-羧基粘康痠6-半醛脫羧酶(hACMSD)的三維結構,併利用Prufile-3D和Procheck等方法評估瞭模型的可靠性.在此慕礎上,用分子對接程序(Affinity),將其底物2-氨基3-羧基粘康痠6-半醛(ACMS)和抑製劑喹啉痠(QA)分彆與hACMSD進行對接,穫得瞭複閤物結構的理論模型.通過配體與受體之間相互作用能和結構分析給齣瞭底物和抑製劑的具體結閤方式,明確瞭hACMSD與底物和抑製劑結閤時起重要作用的氨基痠殘基.
이용동원모건화분자동역학모의방법구건료인류2-안기3-최기점강산6-반철탈최매(hACMSD)적삼유결구,병이용Prufile-3D화Procheck등방법평고료모형적가고성.재차모출상,용분자대접정서(Affinity),장기저물2-안기3-최기점강산6-반철(ACMS)화억제제규람산(QA)분별여hACMSD진행대접,획득료복합물결구적이론모형.통과배체여수체지간상호작용능화결구분석급출료저물화억제제적구체결합방식,명학료hACMSD여저물화억제제결합시기중요작용적안기산잔기.
