CAJ | 학술논문

本研究利用RT-PCR方法分段克隆水牛TLR4 cDNA后拼接成全长,并克隆于pMD20-T载体中,同时运用生物信息学软件对其核苷酸序列及编码蛋白质的结构进行分析和预测.结果表明,克隆的TLR4 cDNA ORF全长2526 bp,共编码841个氨基酸,N端具有由25个氨基酸组成的信号肽,该蛋白预测的分子质量为95.98 ku,等电点为6.37;水牛TLR4与GenBank中登录的水牛TLR4(DQ857349)核苷酸序列同源性达99.01％,与黄牛、绵羊、野猪、马、人和黑猩猩的同源性超过80％,与小鼠和狗的同源性次之,分别为72.17％和61.30％,与鸡的最低,仅为53.94％;该蛋白是由胞外区(1-634位氨基酸)、跨膜区(635-657位氨基酸)和胞内区(658-841位氨基酸)3部分构成的跨膜蛋白,胞外区含有12个LRR串联重复结构域、胞内区具有TIR结构域.本试验成功克隆了水牛TLR4 cDNA全长,并获得了核苷酸及其蛋白质的生物信息学分析数据,为进一步研究其功能奠定了基础.
본연구이용RT-PCR방법분단극륭수우TLR4 cDNA후병접성전장,병극륭우pMD20-T재체중,동시운용생물신식학연건대기핵감산서렬급편마단백질적결구진행분석화예측.결과표명,극륭적TLR4 cDNA ORF전장2526 bp,공편마841개안기산,N단구유유25개안기산조성적신호태,해단백예측적분자질량위95.98 ku,등전점위6.37;수우TLR4여GenBank중등록적수우TLR4(DQ857349)핵감산서렬동원성체99.01％,여황우、면양、야저、마、인화흑성성적동원성초과80％,여소서화구적동원성차지,분별위72.17％화61.30％,여계적최저,부위53.94％;해단백시유포외구(1-634위안기산)、과막구(635-657위안기산)화포내구(658-841위안기산)3부분구성적과막단백,포외구함유12개LRR천련중복결구역、포내구구유TIR결구역.본시험성공극륭료수우TLR4 cDNA전장,병획득료핵감산급기단백질적생물신식학분석수거,위진일보연구기공능전정료기출.