山西农业科学
山西農業科學
산서농업과학
JOURNAL OF SHANXI AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
8期
881-885
,共5页
PCV2%进化分析%ORF3蛋白%生物信息学
PCV2%進化分析%ORF3蛋白%生物信息學
PCV2%진화분석%ORF3단백%생물신식학
对NCBI已经登记的国内分离的PCV2江苏株(GQ358994.1)进行序列比对及进化分析,并对其ORF3编码蛋白的氨基酸序列进行生物信息学方法分析,对其组分、理化性质、跨膜结构域、二级结构、糖基化位点、磷酸化位点和B细胞抗原表位进行预测和推断.结果表明,PCV2江苏株与国内分离株序列同源性极高(＞99％),ORF3蛋白无跨膜区域,二级结构中自由卷曲含量最高,为54.81％,不含有糖基化位点,但有8个磷酸化位点.综合分析得出,ORF3蛋白具有大量的抗原决定簇.通过对ORF3蛋白进行生物信息学方法分析,为PRRSV疫苗设计提供理论基础.
對NCBI已經登記的國內分離的PCV2江囌株(GQ358994.1)進行序列比對及進化分析,併對其ORF3編碼蛋白的氨基痠序列進行生物信息學方法分析,對其組分、理化性質、跨膜結構域、二級結構、糖基化位點、燐痠化位點和B細胞抗原錶位進行預測和推斷.結果錶明,PCV2江囌株與國內分離株序列同源性極高(＞99％),ORF3蛋白無跨膜區域,二級結構中自由捲麯含量最高,為54.81％,不含有糖基化位點,但有8箇燐痠化位點.綜閤分析得齣,ORF3蛋白具有大量的抗原決定簇.通過對ORF3蛋白進行生物信息學方法分析,為PRRSV疫苗設計提供理論基礎.
대NCBI이경등기적국내분리적PCV2강소주(GQ358994.1)진행서렬비대급진화분석,병대기ORF3편마단백적안기산서렬진행생물신식학방법분석,대기조분、이화성질、과막결구역、이급결구、당기화위점、린산화위점화B세포항원표위진행예측화추단.결과표명,PCV2강소주여국내분리주서렬동원성겁고(＞99％),ORF3단백무과막구역,이급결구중자유권곡함량최고,위54.81％,불함유당기화위점,단유8개린산화위점.종합분석득출,ORF3단백구유대량적항원결정족.통과대ORF3단백진행생물신식학방법분석,위PRRSV역묘설계제공이론기출.
