常熟理工学院学报
常熟理工學院學報
상숙리공학원학보
JOURNAL OF CHANGSHU INSTITUTE OF TECHNOLOGY
2010年
4期
76-81
,共6页
朱素华%严六明%纪晓波%陆文聪
硃素華%嚴六明%紀曉波%陸文聰
주소화%엄륙명%기효파%륙문총
分子动力学模拟%阿霉素%水溶液%氢键
分子動力學模擬%阿黴素%水溶液%氫鍵
분자동역학모의%아매소%수용액%경건
用密度泛函方法和分子动力学模拟方法详细研究了具有高效、广谱特点的蒽环类非细胞周期特异性抗肿瘤抗生素阿霉素水溶液的结构特征及其氢键相互作用.其中,密度泛函方法用于优化阿霉素分子的结构,获得用于分子动力学模拟的平衡结构和组成原子的残余电荷;分子动力学模拟研究溶液中阿霉素极性基团周围的冰分布.结果表明,阿霉素周围平均约有10.26个水分子与其极性基团形成氢键;其中,作为质子受体形成7.23个氢键,作为质子供体形成3.03个氢键.由于阿霉素极性基团周围的环境不同,与水的相互作用特性不同:作为质子给体形成氢键的是氨基糖苷上的羟基和氨基,其他极性基团只作为质子受体形成氢键.这些极性基团形成氢键的强度顺序为:位于氨基糖苷的羟基和氨基>醌环羰基和D环烷氧基>B环羟基和A环侧链.
用密度汎函方法和分子動力學模擬方法詳細研究瞭具有高效、廣譜特點的蒽環類非細胞週期特異性抗腫瘤抗生素阿黴素水溶液的結構特徵及其氫鍵相互作用.其中,密度汎函方法用于優化阿黴素分子的結構,穫得用于分子動力學模擬的平衡結構和組成原子的殘餘電荷;分子動力學模擬研究溶液中阿黴素極性基糰週圍的冰分佈.結果錶明,阿黴素週圍平均約有10.26箇水分子與其極性基糰形成氫鍵;其中,作為質子受體形成7.23箇氫鍵,作為質子供體形成3.03箇氫鍵.由于阿黴素極性基糰週圍的環境不同,與水的相互作用特性不同:作為質子給體形成氫鍵的是氨基糖苷上的羥基和氨基,其他極性基糰隻作為質子受體形成氫鍵.這些極性基糰形成氫鍵的彊度順序為:位于氨基糖苷的羥基和氨基>醌環羰基和D環烷氧基>B環羥基和A環側鏈.
용밀도범함방법화분자동역학모의방법상세연구료구유고효、엄보특점적은배류비세포주기특이성항종류항생소아매소수용액적결구특정급기경건상호작용.기중,밀도범함방법용우우화아매소분자적결구,획득용우분자동역학모의적평형결구화조성원자적잔여전하;분자동역학모의연구용액중아매소겁성기단주위적빙분포.결과표명,아매소주위평균약유10.26개수분자여기겁성기단형성경건;기중,작위질자수체형성7.23개경건,작위질자공체형성3.03개경건.유우아매소겁성기단주위적배경불동,여수적상호작용특성불동:작위질자급체형성경건적시안기당감상적간기화안기,기타겁성기단지작위질자수체형성경건.저사겁성기단형성경건적강도순서위:위우안기당감적간기화안기>곤배탄기화D배완양기>B배간기화A배측련.