江苏农业学报
江囌農業學報
강소농업학보
JIANGSU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
6期
1273-1278
,共6页
马振刚%马淑华%张时恒%贾俊杰%李田%潘国庆%周泽扬
馬振剛%馬淑華%張時恆%賈俊傑%李田%潘國慶%週澤颺
마진강%마숙화%장시항%가준걸%리전%반국경%주택양
免耕土%DGGE%16S rDNA%细菌群落%自净能力
免耕土%DGGE%16S rDNA%細菌群落%自淨能力
면경토%DGGE%16S rDNA%세균군락%자정능력
为探明免耕土壤与普通耕作土壤环境中细菌群落的多样性,获取相关优势菌落信息,该研究利用宏基因组学方法获得免耕土和普通耕作土样品总DNA,利用PCR获得16SrDNAV3片段,并进行变性梯度凝胶电泳(Denaturation gradient gel electrophoresis),通过微生物种群丰富度比较两样品中群落的丰富性,同时选取相关DNA条带进行克隆、测序和生物信息学分析.结果显示:免耕土壤中细菌群落多样性更加丰富；两类型土壤样品间细菌群落组成具有显著差异,证明耕作制度影响了土壤细菌群落结构.BLAST分析与系统发生分析结果表明,免耕土壤中特异存在的细菌群落与具有生物固氮、降解甲苯和倍硫磷等特性的细菌序列相似性较高或进化关系较近,推测其在免耕土壤肥力、有毒物质降解及有机质转变等过程中起作用.
為探明免耕土壤與普通耕作土壤環境中細菌群落的多樣性,穫取相關優勢菌落信息,該研究利用宏基因組學方法穫得免耕土和普通耕作土樣品總DNA,利用PCR穫得16SrDNAV3片段,併進行變性梯度凝膠電泳(Denaturation gradient gel electrophoresis),通過微生物種群豐富度比較兩樣品中群落的豐富性,同時選取相關DNA條帶進行剋隆、測序和生物信息學分析.結果顯示:免耕土壤中細菌群落多樣性更加豐富；兩類型土壤樣品間細菌群落組成具有顯著差異,證明耕作製度影響瞭土壤細菌群落結構.BLAST分析與繫統髮生分析結果錶明,免耕土壤中特異存在的細菌群落與具有生物固氮、降解甲苯和倍硫燐等特性的細菌序列相似性較高或進化關繫較近,推測其在免耕土壤肥力、有毒物質降解及有機質轉變等過程中起作用.
위탐명면경토양여보통경작토양배경중세균군락적다양성,획취상관우세균락신식,해연구이용굉기인조학방법획득면경토화보통경작토양품총DNA,이용PCR획득16SrDNAV3편단,병진행변성제도응효전영(Denaturation gradient gel electrophoresis),통과미생물충군봉부도비교량양품중군락적봉부성,동시선취상관DNA조대진행극륭、측서화생물신식학분석.결과현시:면경토양중세균군락다양성경가봉부；량류형토양양품간세균군락조성구유현저차이,증명경작제도영향료토양세균군락결구.BLAST분석여계통발생분석결과표명,면경토양중특이존재적세균군락여구유생물고담、강해갑분화배류린등특성적세균서렬상사성교고혹진화관계교근,추측기재면경토양비력、유독물질강해급유궤질전변등과정중기작용.
