CAJ | 학술논문

以传染性法氏囊病病毒(IBDV)浙江分离株(ZJ2000)基因组RNA为模板,采用Long-accurate RT-PCR(LA-PCR)一步法扩增并克隆了IBDV ZJ2000株基因组A节段全长cDNA.序列测定结果表明,克隆的A节段全长共3 259个核苷酸,包括5'、3'端的非编码区(NCRs)和2个部分重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2),与参比的血清I型毒株核苷酸序列的同源性高达95.2%～99.2%.二级结构预测表明,在5'-NCRs和3'-NCRs存在1个大型的茎环发夹结构.ORF2编码145个氨基酸的VP5,与参比毒株的同源性高达98.6%～100%.ORF1编码1 012个氨基酸的VP2/VP4/VP3,在氨基酸水平上VP2、VP3、VP4与参比毒株的同源性分别达94.9%～98.8%、96.1%～98.5%、97.1%～99.2%.ZJ2000共有14～38个氨基酸的替代,其中特有氨基酸6个,变异大多数集中在VP2高变区,突变率达2.9%～11%.第2个小亲水区内280位氨基酸由S替代了N、290位M替代了L.这2个突变可能与IBDV的抗原性有关.VP2-VP4剪切位点附近511和540位氨基酸的变异可能使ZJ2000株的毒力增强.分子系统进化树分析表明,ZJ2000与欧洲Cu-1株、P2株、CEF94株和中国Harbin株的关系最近,而与欧洲、香港、日本的超强毒株和美国的变异株相对较远.
이전염성법씨낭병병독(IBDV)절강분리주(ZJ2000)기인조RNA위모판,채용Long-accurate RT-PCR(LA-PCR)일보법확증병극륭료IBDV ZJ2000주기인조A절단전장cDNA.서렬측정결과표명,극륭적A절단전장공3 259개핵감산,포괄5'、3'단적비편마구(NCRs)화2개부분중첩적개방열독광(ORF1화ORF2),여삼비적혈청I형독주핵감산서렬적동원성고체95.2%～99.2%.이급결구예측표명,재5'-NCRs화3'-NCRs존재1개대형적경배발협결구.ORF2편마145개안기산적VP5,여삼비독주적동원성고체98.6%～100%.ORF1편마1 012개안기산적VP2/VP4/VP3,재안기산수평상VP2、VP3、VP4여삼비독주적동원성분별체94.9%～98.8%、96.1%～98.5%、97.1%～99.2%.ZJ2000공유14～38개안기산적체대,기중특유안기산6개,변이대다수집중재VP2고변구,돌변솔체2.9%～11%.제2개소친수구내280위안기산유S체대료N、290위M체대료L.저2개돌변가능여IBDV적항원성유관.VP2-VP4전절위점부근511화540위안기산적변이가능사ZJ2000주적독력증강.분자계통진화수분석표명,ZJ2000여구주Cu-1주、P2주、CEF94주화중국Harbin주적관계최근,이여구주、향항、일본적초강독주화미국적변이주상대교원.