CAJ | 학술논문

为了给西瓜遗传基础研究提供新的共显性分子标记,对公共数据中的8619条西瓜EST序列进行处理和分析,获得202个EST-SSR,分布在191条EST序列中,出现频率为2.31%,分布密度为1/19.1kb.其优势重复基序为二核苷酸和三核苷酸(68.8%),在二核苷酸基序中以AG/TG类型为最多(46%);在三核苷酸基序中,以AAG类型为最多(43%).基序重复次数以4次(17.8%)、7次(15.3%)和11次(14.9%)为最多.长度主要分布在20～30 bp(76%).利用上述EST-SSR序列设计获得24对引物在西瓜白化致死近等基因系中进行验证,结果获得了16对有效的扩增引物,占总设计引物对数的66.7%.结果表明:利用公共数据库中的EST序列开发西瓜EST-SSR标记是一种有效的方法.
위료급서과유전기출연구제공신적공현성분자표기,대공공수거중적8619조서과EST서렬진행처리화분석,획득202개EST-SSR,분포재191조EST서렬중,출현빈솔위2.31%,분포밀도위1/19.1kb.기우세중복기서위이핵감산화삼핵감산(68.8%),재이핵감산기서중이AG/TG류형위최다(46%);재삼핵감산기서중,이AAG류형위최다(43%).기서중복차수이4차(17.8%)、7차(15.3%)화11차(14.9%)위최다.장도주요분포재20～30 bp(76%).이용상술EST-SSR서렬설계획득24대인물재서과백화치사근등기인계중진행험증,결과획득료16대유효적확증인물,점총설계인물대수적66.7%.결과표명:이용공공수거고중적EST서렬개발서과EST-SSR표기시일충유효적방법.