畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2012年
8期
1306-1309
,共4页
白小青%刘文%黄微%王鹏%孙艳%王金勇
白小青%劉文%黃微%王鵬%孫豔%王金勇
백소청%류문%황미%왕붕%손염%왕금용
荣昌猪%SLA-DQB%突变分析%蛋白质序列模式预测
榮昌豬%SLA-DQB%突變分析%蛋白質序列模式預測
영창저%SLA-DQB%돌변분석%단백질서렬모식예측
为了深入了解荣昌猪SLA DQB基因β1结构域的变异及蛋白质序列模式分布情况,对53头荣昌猪SLADQB基因的β1结构域进行了克隆测序和序列多重比对,并在线预测蛋白质序列模式.结果发现,222 bp区域内存在9个单核苷酸的插入位点、16个单核苷酸的缺失位点和89个SNPs位点.74个氨基酸中仅由SNP位点导致的氨基酸变异位点共37个,其中有24个位点氨基酸的类型发生变化.对50条SLA- DQB基因β1结构域蛋白质序列分析发现7种类型共174个蛋白质序列模式位点.单条序列中蛋白质序列模式位点最多的12个,最少的2个.蛋白质序列模式突变位点主要发生在第9、26、45、53、61个氨基酸上,涉及到5种类型蛋白质序列模式位点的改变.结果提示,荣昌猪5L A- DQB基因β1结构域存在丰富的遗传变异和多样化的蛋白质序列模式.
為瞭深入瞭解榮昌豬SLA DQB基因β1結構域的變異及蛋白質序列模式分佈情況,對53頭榮昌豬SLADQB基因的β1結構域進行瞭剋隆測序和序列多重比對,併在線預測蛋白質序列模式.結果髮現,222 bp區域內存在9箇單覈苷痠的插入位點、16箇單覈苷痠的缺失位點和89箇SNPs位點.74箇氨基痠中僅由SNP位點導緻的氨基痠變異位點共37箇,其中有24箇位點氨基痠的類型髮生變化.對50條SLA- DQB基因β1結構域蛋白質序列分析髮現7種類型共174箇蛋白質序列模式位點.單條序列中蛋白質序列模式位點最多的12箇,最少的2箇.蛋白質序列模式突變位點主要髮生在第9、26、45、53、61箇氨基痠上,涉及到5種類型蛋白質序列模式位點的改變.結果提示,榮昌豬5L A- DQB基因β1結構域存在豐富的遺傳變異和多樣化的蛋白質序列模式.
위료심입료해영창저SLA DQB기인β1결구역적변이급단백질서렬모식분포정황,대53두영창저SLADQB기인적β1결구역진행료극륭측서화서렬다중비대,병재선예측단백질서렬모식.결과발현,222 bp구역내존재9개단핵감산적삽입위점、16개단핵감산적결실위점화89개SNPs위점.74개안기산중부유SNP위점도치적안기산변이위점공37개,기중유24개위점안기산적류형발생변화.대50조SLA- DQB기인β1결구역단백질서렬분석발현7충류형공174개단백질서렬모식위점.단조서렬중단백질서렬모식위점최다적12개,최소적2개.단백질서렬모식돌변위점주요발생재제9、26、45、53、61개안기산상,섭급도5충류형단백질서렬모식위점적개변.결과제시,영창저5L A- DQB기인β1결구역존재봉부적유전변이화다양화적단백질서렬모식.
