微生物学通报
微生物學通報
미생물학통보
MICROBIOLOGY
2008年
9期
1500-1504
,共5页
蔡曼%职晓阳%吴晋元%唐蜀昆%李文均
蔡曼%職曉暘%吳晉元%唐蜀昆%李文均
채만%직효양%오진원%당촉곤%리문균
PCR-SSCP%链单孢菌属%快速筛选
PCR-SSCP%鏈單孢菌屬%快速篩選
PCR-SSCP%련단포균속%쾌속사선
为提高嗜盐放线茵的研究效率,快速、准确的从大量分离菌株中去除重复菌株、筛选出目的菌株,在特异性引物快速定属的基础上,以嗜盐放线茵链单孢茵属的34株菌株为研究对象,采用与PCR相结合的单链构象多态性分析(PCR-SSCP),扩增出16S rRNA基因中的两个高变区,根据结果对34株菌株进行聚类分析,并将其16S rRNA基因片段测序予以验证.结果表明,聚类后34株菌株可大致分为3类,且与16S rRNA基因片段分析结果一致.从而可快速去除重复菌株并反映出菌株间的系统进化关系.同时实验数据可构建成库,使后续分离菌株的筛选工作只需比对数据即可完成,利于提高工作效率,降低实验成本.
為提高嗜鹽放線茵的研究效率,快速、準確的從大量分離菌株中去除重複菌株、篩選齣目的菌株,在特異性引物快速定屬的基礎上,以嗜鹽放線茵鏈單孢茵屬的34株菌株為研究對象,採用與PCR相結閤的單鏈構象多態性分析(PCR-SSCP),擴增齣16S rRNA基因中的兩箇高變區,根據結果對34株菌株進行聚類分析,併將其16S rRNA基因片段測序予以驗證.結果錶明,聚類後34株菌株可大緻分為3類,且與16S rRNA基因片段分析結果一緻.從而可快速去除重複菌株併反映齣菌株間的繫統進化關繫.同時實驗數據可構建成庫,使後續分離菌株的篩選工作隻需比對數據即可完成,利于提高工作效率,降低實驗成本.
위제고기염방선인적연구효솔,쾌속、준학적종대량분리균주중거제중복균주、사선출목적균주,재특이성인물쾌속정속적기출상,이기염방선인련단포인속적34주균주위연구대상,채용여PCR상결합적단련구상다태성분석(PCR-SSCP),확증출16S rRNA기인중적량개고변구,근거결과대34주균주진행취류분석,병장기16S rRNA기인편단측서여이험증.결과표명,취류후34주균주가대치분위3류,차여16S rRNA기인편단분석결과일치.종이가쾌속거제중복균주병반영출균주간적계통진화관계.동시실험수거가구건성고,사후속분리균주적사선공작지수비대수거즉가완성,리우제고공작효솔,강저실험성본.
