辽宁师范大学学报(自然科学版)
遼寧師範大學學報(自然科學版)
료녕사범대학학보(자연과학판)
Journal of Liaonin g Normal University
2004年
1期
80-84
,共5页
王翔%孙毅%王黎%于业飞%李庆伟
王翔%孫毅%王黎%于業飛%李慶偉
왕상%손의%왕려%우업비%리경위
线粒体基因%tRNA基因簇%二级结构%系统发育%雀科
線粒體基因%tRNA基因簇%二級結構%繫統髮育%雀科
선립체기인%tRNA기인족%이급결구%계통발육%작과
利用PCR方法对雀科9种鸟类11个线粒体基因组中3个主要的tRNA基因簇,即IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet),WANCY(tRNATrp-tlRNAAla-tRNAsn-tRNACyB-tRNATyr)和HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CUN))进行扩增和序列测定,这些tRNA基因序列中可变核苷酸位点占15%,其中59%出现在环区,且存在插入核苷酸;茎区相对保守,其中一些变异如双链的互补性碱基突变,G-u配对等对于维系tRNA二级结构的稳定性非常重要.利用11个线粒体tRNA基因全序列,以鹌鹑为外群构建了雀科9种鸟类的系统发育树,结果表明:黄雀与其它物种关系较远;鹀亚科中灰头鹀与雀亚科关系最近,而小鹀与三道眉草鹀比较特化,这与根据二级结构特征得出的结论相吻合.利用茎区序列构建的NJ树在鹀亚科物种的分类地位上存在分歧,可能是由于核苷酸数目较少,信息量小,在解决近缘物种间的分类地位时受到限制.结合线粒体tRNA基因二级结构特征比较和系统发育分析,初步认为线粒体tRNA基因二级结构特征对于推断雀科属间的分类地位具有较高的置信度.
利用PCR方法對雀科9種鳥類11箇線粒體基因組中3箇主要的tRNA基因簇,即IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet),WANCY(tRNATrp-tlRNAAla-tRNAsn-tRNACyB-tRNATyr)和HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CUN))進行擴增和序列測定,這些tRNA基因序列中可變覈苷痠位點佔15%,其中59%齣現在環區,且存在插入覈苷痠;莖區相對保守,其中一些變異如雙鏈的互補性堿基突變,G-u配對等對于維繫tRNA二級結構的穩定性非常重要.利用11箇線粒體tRNA基因全序列,以鵪鶉為外群構建瞭雀科9種鳥類的繫統髮育樹,結果錶明:黃雀與其它物種關繫較遠;鹀亞科中灰頭鹀與雀亞科關繫最近,而小鹀與三道眉草鹀比較特化,這與根據二級結構特徵得齣的結論相吻閤.利用莖區序列構建的NJ樹在鹀亞科物種的分類地位上存在分歧,可能是由于覈苷痠數目較少,信息量小,在解決近緣物種間的分類地位時受到限製.結閤線粒體tRNA基因二級結構特徵比較和繫統髮育分析,初步認為線粒體tRNA基因二級結構特徵對于推斷雀科屬間的分類地位具有較高的置信度.
이용PCR방법대작과9충조류11개선립체기인조중3개주요적tRNA기인족,즉IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet),WANCY(tRNATrp-tlRNAAla-tRNAsn-tRNACyB-tRNATyr)화HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CUN))진행확증화서렬측정,저사tRNA기인서렬중가변핵감산위점점15%,기중59%출현재배구,차존재삽입핵감산;경구상대보수,기중일사변이여쌍련적호보성감기돌변,G-u배대등대우유계tRNA이급결구적은정성비상중요.이용11개선립체tRNA기인전서렬,이암순위외군구건료작과9충조류적계통발육수,결과표명:황작여기타물충관계교원;무아과중회두무여작아과관계최근,이소무여삼도미초무비교특화,저여근거이급결구특정득출적결론상문합.이용경구서렬구건적NJ수재무아과물충적분류지위상존재분기,가능시유우핵감산수목교소,신식량소,재해결근연물충간적분류지위시수도한제.결합선립체tRNA기인이급결구특정비교화계통발육분석,초보인위선립체tRNA기인이급결구특정대우추단작과속간적분류지위구유교고적치신도.