北京大学学报(自然科学版)
北京大學學報(自然科學版)
북경대학학보(자연과학판)
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS PEKINENSIS
2004年
4期
518-526
,共9页
CCR5%分子动力学模拟%N末端区域%二硫键%HIV
CCR5%分子動力學模擬%N末耑區域%二硫鍵%HIV
CCR5%분자동역학모의%N말단구역%이류건%HIV
人类化学趋化因子受体CCR5是HIV-1病毒进入人体细胞的主要辅助受体.实验表明,CCR5分子的N末端区域对化学趋化因子结合以及HIV病毒入侵起关键作用.用同源模建的方法构建CC R5结构模型,并对该模型的胞外结构域进行了1ns高温分子动力学和200ps常温分子动力学模拟.结果表明,CCR5的胞外结构域整体上表现为一个包装紧密的球形构象,二硫键Cys20 - Cys269对这一构象的形成以及N末端区域的空间取向起关键作用,同时,二硫键的存在使N末端1-19区域定位在胞外结构域的顶部,并增加N末端构象柔性,使其有机会伸展到胞外空间去.根据这一结果和现有的实验证据,提出了HIV-CCR5两步结合机制.
人類化學趨化因子受體CCR5是HIV-1病毒進入人體細胞的主要輔助受體.實驗錶明,CCR5分子的N末耑區域對化學趨化因子結閤以及HIV病毒入侵起關鍵作用.用同源模建的方法構建CC R5結構模型,併對該模型的胞外結構域進行瞭1ns高溫分子動力學和200ps常溫分子動力學模擬.結果錶明,CCR5的胞外結構域整體上錶現為一箇包裝緊密的毬形構象,二硫鍵Cys20 - Cys269對這一構象的形成以及N末耑區域的空間取嚮起關鍵作用,同時,二硫鍵的存在使N末耑1-19區域定位在胞外結構域的頂部,併增加N末耑構象柔性,使其有機會伸展到胞外空間去.根據這一結果和現有的實驗證據,提齣瞭HIV-CCR5兩步結閤機製.
인류화학추화인자수체CCR5시HIV-1병독진입인체세포적주요보조수체.실험표명,CCR5분자적N말단구역대화학추화인자결합이급HIV병독입침기관건작용.용동원모건적방법구건CC R5결구모형,병대해모형적포외결구역진행료1ns고온분자동역학화200ps상온분자동역학모의.결과표명,CCR5적포외결구역정체상표현위일개포장긴밀적구형구상,이류건Cys20 - Cys269대저일구상적형성이급N말단구역적공간취향기관건작용,동시,이류건적존재사N말단1-19구역정위재포외결구역적정부,병증가N말단구상유성,사기유궤회신전도포외공간거.근거저일결과화현유적실험증거,제출료HIV-CCR5량보결합궤제.
