遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2003年
4期
373-382
,共10页
吴松锋%杜春娟%万平%陈廷贵%荔建琦%李栋%朱云平%曾衍钧%贺福初
吳鬆鋒%杜春娟%萬平%陳廷貴%荔建琦%李棟%硃雲平%曾衍鈞%賀福初
오송봉%두춘연%만평%진정귀%려건기%리동%주운평%증연균%하복초
严重急性呼吸系统综合征(SARS)%冠状病毒%多态%进化%s2m
嚴重急性呼吸繫統綜閤徵(SARS)%冠狀病毒%多態%進化%s2m
엄중급성호흡계통종합정(SARS)%관상병독%다태%진화%s2m
对病毒种内和种间基因组的比较分析能获得很多关于病毒起源与演化的信息.对17株SARS-CoV的种内基因组变异分析发现共有137个变异位点,估算出SARS-CoV的突变率为8.04×10-3核苷酸替换/位点/年.变异位点在基因组上的分布不均匀,变异位点最多的是基因组中编码S1蛋白的区域,而在编码依赖于RNA的RNA聚合酶区域中几乎没有变异位点.核苷酸和氨基酸替换的偏性预示变异可能不仅仅是由随机漂变产生.对冠状病毒种间基因组结构比较分析发现,SARS-CoV的基因组结构与IBV很相似;而保守基因系统发育分析表明,SARS-CoV属于冠状病毒的一个新分支,并且与血清型第二组冠状病毒进化关系较近.对其他某些分子特征的分析发现,在不同的方面SARS-CoV和不同组冠状病毒有不同的相似点.进一步对基因组非保守开放阅读框(ORF)的基序(motif)和跨膜区分析发现,各组冠状病毒基因组中位于基因S-E间的非保守ORF可能是同源的,但不是绝对必要的;而IBV和SARS-CoV的基因组中位于基因M-N间ORF可能不是同源的.综合分析SARS-CoV与3组血清型冠状病毒进化关系、宿主分布,以及SARS-CoV和IBV的s2m的进化关系,可以推测SARS-CoV有可能来自禽类.
對病毒種內和種間基因組的比較分析能穫得很多關于病毒起源與縯化的信息.對17株SARS-CoV的種內基因組變異分析髮現共有137箇變異位點,估算齣SARS-CoV的突變率為8.04×10-3覈苷痠替換/位點/年.變異位點在基因組上的分佈不均勻,變異位點最多的是基因組中編碼S1蛋白的區域,而在編碼依賴于RNA的RNA聚閤酶區域中幾乎沒有變異位點.覈苷痠和氨基痠替換的偏性預示變異可能不僅僅是由隨機漂變產生.對冠狀病毒種間基因組結構比較分析髮現,SARS-CoV的基因組結構與IBV很相似;而保守基因繫統髮育分析錶明,SARS-CoV屬于冠狀病毒的一箇新分支,併且與血清型第二組冠狀病毒進化關繫較近.對其他某些分子特徵的分析髮現,在不同的方麵SARS-CoV和不同組冠狀病毒有不同的相似點.進一步對基因組非保守開放閱讀框(ORF)的基序(motif)和跨膜區分析髮現,各組冠狀病毒基因組中位于基因S-E間的非保守ORF可能是同源的,但不是絕對必要的;而IBV和SARS-CoV的基因組中位于基因M-N間ORF可能不是同源的.綜閤分析SARS-CoV與3組血清型冠狀病毒進化關繫、宿主分佈,以及SARS-CoV和IBV的s2m的進化關繫,可以推測SARS-CoV有可能來自禽類.
대병독충내화충간기인조적비교분석능획득흔다관우병독기원여연화적신식.대17주SARS-CoV적충내기인조변이분석발현공유137개변이위점,고산출SARS-CoV적돌변솔위8.04×10-3핵감산체환/위점/년.변이위점재기인조상적분포불균균,변이위점최다적시기인조중편마S1단백적구역,이재편마의뢰우RNA적RNA취합매구역중궤호몰유변이위점.핵감산화안기산체환적편성예시변이가능불부부시유수궤표변산생.대관상병독충간기인조결구비교분석발현,SARS-CoV적기인조결구여IBV흔상사;이보수기인계통발육분석표명,SARS-CoV속우관상병독적일개신분지,병차여혈청형제이조관상병독진화관계교근.대기타모사분자특정적분석발현,재불동적방면SARS-CoV화불동조관상병독유불동적상사점.진일보대기인조비보수개방열독광(ORF)적기서(motif)화과막구분석발현,각조관상병독기인조중위우기인S-E간적비보수ORF가능시동원적,단불시절대필요적;이IBV화SARS-CoV적기인조중위우기인M-N간ORF가능불시동원적.종합분석SARS-CoV여3조혈청형관상병독진화관계、숙주분포,이급SARS-CoV화IBV적s2m적진화관계,가이추측SARS-CoV유가능래자금류.
