应用概率统计
應用概率統計
응용개솔통계
CHINESE JOURNAL OF APPLIED PROBABILITY AND STATISTICS
2010年
4期
357-366
,共10页
系统发育树%EM算法%Jukes-Cantor模型%Kimura模型%参数估计
繫統髮育樹%EM算法%Jukes-Cantor模型%Kimura模型%參數估計
계통발육수%EM산법%Jukes-Cantor모형%Kimura모형%삼수고계
系统发育学研究物种之间的进化关系,其核苷酸替代模型通常假设序列进化没有数据的缺损和删失,而现实中这个假设条件是很难满足的.针对这种事实,本文将运用EM算法对存在插入或缺失但序列长度假设不变的观测序列构建系统发育树进行参数估计,为含缺损数据序列构建良好的系统发育树作铺垫.重点在于运用EM算法做Jukes-Cantor模型、Kimura模型下含缺损数据的DNA序列构建有根树或无根树最佳分枝长度等的参数估计.
繫統髮育學研究物種之間的進化關繫,其覈苷痠替代模型通常假設序列進化沒有數據的缺損和刪失,而現實中這箇假設條件是很難滿足的.針對這種事實,本文將運用EM算法對存在插入或缺失但序列長度假設不變的觀測序列構建繫統髮育樹進行參數估計,為含缺損數據序列構建良好的繫統髮育樹作鋪墊.重點在于運用EM算法做Jukes-Cantor模型、Kimura模型下含缺損數據的DNA序列構建有根樹或無根樹最佳分枝長度等的參數估計.
계통발육학연구물충지간적진화관계,기핵감산체대모형통상가설서렬진화몰유수거적결손화산실,이현실중저개가설조건시흔난만족적.침대저충사실,본문장운용EM산법대존재삽입혹결실단서렬장도가설불변적관측서렬구건계통발육수진행삼수고계,위함결손수거서렬구건량호적계통발육수작포점.중점재우운용EM산법주Jukes-Cantor모형、Kimura모형하함결손수거적DNA서렬구건유근수혹무근수최가분지장도등적삼수고계.
