中国畜牧兽医
中國畜牧獸醫
중국축목수의
CHINA ANIMAL HUSBANDRY & VETERINARY MEDICINE
2012年
10期
33-37
,共5页
卜艳珍%勾利美%赵鹏飞%王小攀
蔔豔珍%勾利美%趙鵬飛%王小攀
복염진%구리미%조붕비%왕소반
冠环线虫%内转录间隔区(ITS)%PCR%序列分析
冠環線蟲%內轉錄間隔區(ITS)%PCR%序列分析
관배선충%내전록간격구(ITS)%PCR%서렬분석
本试验利用PCR扩增3种冠环线虫5个样品的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)及5.8S片段,将PCR扩增产物纯化后直接进行序列测定和分析.序列比对和分析结果显示,所测样品ITS1-5.8S-ITS2的长度范围为748～843 bp,总变异位点(包括gaps)119个,简约信息位点18个；其中ITS1和ITS2的长度范围分别为367～370 bp和228～320 bp,变异位点分别为14个和105个,简约信息位点均为9个.所有测试样品的5.8S片段完全相同,长度为153 bp.5条序列ITS1区的G+C 含量(48.0％～48.5％)明显高于ITS2区(37.7％～40.3％).通过序列两两比对,3种冠环线虫ITS1和ITS2的种间差异性分别为1.9％～3.5％和5.6％～31.8％；而种内差异性分别为0～0.5％和0～0.9％.并且所测序列与GenBank中已知序列的同源性为99.07％～99.41％.本研究认为,ITS序列可以作为冠环线虫种类鉴定的分子标记.
本試驗利用PCR擴增3種冠環線蟲5箇樣品的覈糖體DNA內轉錄間隔區(ITS)及5.8S片段,將PCR擴增產物純化後直接進行序列測定和分析.序列比對和分析結果顯示,所測樣品ITS1-5.8S-ITS2的長度範圍為748～843 bp,總變異位點(包括gaps)119箇,簡約信息位點18箇；其中ITS1和ITS2的長度範圍分彆為367～370 bp和228～320 bp,變異位點分彆為14箇和105箇,簡約信息位點均為9箇.所有測試樣品的5.8S片段完全相同,長度為153 bp.5條序列ITS1區的G+C 含量(48.0％～48.5％)明顯高于ITS2區(37.7％～40.3％).通過序列兩兩比對,3種冠環線蟲ITS1和ITS2的種間差異性分彆為1.9％～3.5％和5.6％～31.8％；而種內差異性分彆為0～0.5％和0～0.9％.併且所測序列與GenBank中已知序列的同源性為99.07％～99.41％.本研究認為,ITS序列可以作為冠環線蟲種類鑒定的分子標記.
본시험이용PCR확증3충관배선충5개양품적핵당체DNA내전록간격구(ITS)급5.8S편단,장PCR확증산물순화후직접진행서렬측정화분석.서렬비대화분석결과현시,소측양품ITS1-5.8S-ITS2적장도범위위748～843 bp,총변이위점(포괄gaps)119개,간약신식위점18개；기중ITS1화ITS2적장도범위분별위367～370 bp화228～320 bp,변이위점분별위14개화105개,간약신식위점균위9개.소유측시양품적5.8S편단완전상동,장도위153 bp.5조서렬ITS1구적G+C 함량(48.0％～48.5％)명현고우ITS2구(37.7％～40.3％).통과서렬량량비대,3충관배선충ITS1화ITS2적충간차이성분별위1.9％～3.5％화5.6％～31.8％；이충내차이성분별위0～0.5％화0～0.9％.병차소측서렬여GenBank중이지서렬적동원성위99.07％～99.41％.본연구인위,ITS서렬가이작위관배선충충류감정적분자표기.
