微电子学与计算机
微電子學與計算機
미전자학여계산궤
MICROELECTRONICS & COMPUTER
2007年
7期
35-39
,共5页
磷酸化%预测%氨基酸性质%AdaBoost
燐痠化%預測%氨基痠性質%AdaBoost
린산화%예측%안기산성질%AdaBoost
磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一,随着蛋白质磷酸化修饰数据不断积累,利用已有数据进行蛋白质磷酸化修饰位点预测的条件日益成熟.利用修饰位点附近氨基酸性质取代氨基酸种类作为特征,对现有516种氨基酸性质做了详细分析和筛选,提出了采用AdaBoost方法进行特征选择和分类器训练的磷酸化修饰位点预测系统AproPhos,该系统在特异性高于已有预测系统(约2%)的基础上,大大提高了预测的灵敏度(约10%),使磷酸化位点预测方法用于提高磷酸化蛋白质质谱鉴定效率成为可能,并有发现磷酸化修饰位点氨基酸性质分布的潜力.
燐痠化是最重要的蛋白質翻譯後脩飾之一,隨著蛋白質燐痠化脩飾數據不斷積纍,利用已有數據進行蛋白質燐痠化脩飾位點預測的條件日益成熟.利用脩飾位點附近氨基痠性質取代氨基痠種類作為特徵,對現有516種氨基痠性質做瞭詳細分析和篩選,提齣瞭採用AdaBoost方法進行特徵選擇和分類器訓練的燐痠化脩飾位點預測繫統AproPhos,該繫統在特異性高于已有預測繫統(約2%)的基礎上,大大提高瞭預測的靈敏度(約10%),使燐痠化位點預測方法用于提高燐痠化蛋白質質譜鑒定效率成為可能,併有髮現燐痠化脩飾位點氨基痠性質分佈的潛力.
린산화시최중요적단백질번역후수식지일,수착단백질린산화수식수거불단적루,이용이유수거진행단백질린산화수식위점예측적조건일익성숙.이용수식위점부근안기산성질취대안기산충류작위특정,대현유516충안기산성질주료상세분석화사선,제출료채용AdaBoost방법진행특정선택화분류기훈련적린산화수식위점예측계통AproPhos,해계통재특이성고우이유예측계통(약2%)적기출상,대대제고료예측적령민도(약10%),사린산화위점예측방법용우제고린산화단백질질보감정효솔성위가능,병유발현린산화수식위점안기산성질분포적잠력.
