黑龙江畜牧兽医
黑龍江畜牧獸醫
흑룡강축목수의
HEILONGJIANG JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE AND VETERINARY MEDICINE
2009年
2期
16-18
,共3页
陈轶霞%乔自林%刘俊林%王明明%陆会宁%郑亚东%陈智华
陳軼霞%喬自林%劉俊林%王明明%陸會寧%鄭亞東%陳智華
진질하%교자림%류준림%왕명명%륙회저%정아동%진지화
绵羊痘病毒%ORFl21%序列分析%B细胞表位
綿羊痘病毒%ORFl21%序列分析%B細胞錶位
면양두병독%ORFl21%서렬분석%B세포표위
选取GenBank上4株不同绵羊痘毒株ORF121基因序列,采用DNASTAR软件对该基因序列进行同源性分析,并以B细胞表位分析参数及蛋白质二级结构分析数据,综合预测ORFl21蛋白B细胞表位.结果表明:4株不同绵羊痘毒株ORF121基因核苷酸序列的同源性为99%;在ORFl21蛋白的肽链中,35～46、76～82、160～167区段亲水性强,35～45、54～83、90～124、130～139、144～158和160～167区段柔韧性好,37～45、112～116、129～137和143～167区段抗原指数高,33～45、78～83和159～167区段表面可及性高,30～57和151～170区段可形成一定的空间构象.结果说明ORF121基因在不同的绵羊痘病毒流行株之间非常保守,ORF121蛋白35～45、160～167区段可能是B细胞表位优势区.具有潜在的疫苗或/和诊断价值.
選取GenBank上4株不同綿羊痘毒株ORF121基因序列,採用DNASTAR軟件對該基因序列進行同源性分析,併以B細胞錶位分析參數及蛋白質二級結構分析數據,綜閤預測ORFl21蛋白B細胞錶位.結果錶明:4株不同綿羊痘毒株ORF121基因覈苷痠序列的同源性為99%;在ORFl21蛋白的肽鏈中,35～46、76～82、160～167區段親水性彊,35～45、54～83、90～124、130～139、144～158和160～167區段柔韌性好,37～45、112～116、129～137和143～167區段抗原指數高,33～45、78～83和159～167區段錶麵可及性高,30～57和151～170區段可形成一定的空間構象.結果說明ORF121基因在不同的綿羊痘病毒流行株之間非常保守,ORF121蛋白35～45、160～167區段可能是B細胞錶位優勢區.具有潛在的疫苗或/和診斷價值.
선취GenBank상4주불동면양두독주ORF121기인서렬,채용DNASTAR연건대해기인서렬진행동원성분석,병이B세포표위분석삼수급단백질이급결구분석수거,종합예측ORFl21단백B세포표위.결과표명:4주불동면양두독주ORF121기인핵감산서렬적동원성위99%;재ORFl21단백적태련중,35～46、76～82、160～167구단친수성강,35～45、54～83、90～124、130～139、144～158화160～167구단유인성호,37～45、112～116、129～137화143～167구단항원지수고,33～45、78～83화159～167구단표면가급성고,30～57화151～170구단가형성일정적공간구상.결과설명ORF121기인재불동적면양두병독류행주지간비상보수,ORF121단백35～45、160～167구단가능시B세포표위우세구.구유잠재적역묘혹/화진단개치.
