中国海洋大学学报(自然科学版)
中國海洋大學學報(自然科學版)
중국해양대학학보(자연과학판)
PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA
2010年
12期
51-56
,共6页
王娜%蔡玉勇%李赟%王崇明%崔红
王娜%蔡玉勇%李赟%王崇明%崔紅
왕나%채옥용%리빈%왕숭명%최홍
PCR-DGGE%18S rDNA序列%真核浮游生物多样性
PCR-DGGE%18S rDNA序列%真覈浮遊生物多樣性
PCR-DGGE%18S rDNA서렬%진핵부유생물다양성
为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列.筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析町将不同藻种分离开.随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带.其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%.不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632.相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微牛物种类相似性最高,为89.7%.基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高.
為分析扇貝養殖海區真覈浮遊生物種類和豐度,本研究首先以實驗室培養的9種餌料微藻總DNA為模闆PCR擴增18S rDNA V1~V3區的高變區序列.篩選用于DGGE分析該擴增序列的變性劑濃度,結果錶明,擴增序列長560 bp,DGGE分析町將不同藻種分離開.隨後對青島沙子口扇貝養殖海區9箇月份真覈浮遊生物多樣性進行瞭DGGE分析,結果從9箇月份2 m深的海水中總共擴增齣38條譜帶.其中共有譜帶3條,佔總數的7.69%,不同月份的特徵性譜帶11箇,佔總譜帶數的28.2%.不同月份水樣中的譜帶數顯著不同,香農多樣性指數為0.4632.相似性分析錶明,2009年3和4月養殖海區真覈微牛物種類相似性最高,為89.7%.基于不同月份水樣微生物種類多樣性進行UPGMA聚類分析,結果錶明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分彆聚為一支,顯示取樣時間相近的月份微生物種類相似度最高.
위분석선패양식해구진핵부유생물충류화봉도,본연구수선이실험실배양적9충이료미조총DNA위모판PCR확증18S rDNA V1~V3구적고변구서렬.사선용우DGGE분석해확증서렬적변성제농도,결과표명,확증서렬장560 bp,DGGE분석정장불동조충분리개.수후대청도사자구선패양식해구9개월빈진핵부유생물다양성진행료DGGE분석,결과종9개월빈2 m심적해수중총공확증출38조보대.기중공유보대3조,점총수적7.69%,불동월빈적특정성보대11개,점총보대수적28.2%.불동월빈수양중적보대수현저불동,향농다양성지수위0.4632.상사성분석표명,2009년3화4월양식해구진핵미우물충류상사성최고,위89.7%.기우불동월빈수양미생물충류다양성진행UPGMA취류분석,결과표명,2008년5,6,8월화2009년1,2,3,4월분별취위일지,현시취양시간상근적월빈미생물충류상사도최고.