基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2012年
4期
394-400
,共7页
王新新%吴亮%朱生凤%李广茹%赵林%吕妍%李飞雪%陈宇
王新新%吳亮%硃生鳳%李廣茹%趙林%呂妍%李飛雪%陳宇
왕신신%오량%주생봉%리엄여%조림%려연%리비설%진우
茎瘤固氮根瘤菌%ORS571%基因组%分泌蛋白%核酸酶%抗氧化酶
莖瘤固氮根瘤菌%ORS571%基因組%分泌蛋白%覈痠酶%抗氧化酶
경류고담근류균%ORS571%기인조%분비단백%핵산매%항양화매
为了获取茎瘤固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans ORS571)的分泌蛋白,以便更深入地了解该菌的共生固氮作用,本研究采用SignalP、TMHMM、PSORTb、TargetP、LipoP、TatP和SecretomeP软件对该菌全部4 717个蛋白序列进行分析预测.结果共识别了653个分泌蛋白,其中具有分泌型信号肽的蛋白54个,具有RR-motif型信号肽的蛋白1个,具有脂蛋白信号肽的蛋白2个和非经典分泌蛋白596个.该菌含信号肽分泌蛋白仅占全部蛋白的1.2%,低于其它固氮菌.在分泌蛋白中识别了核酸内切酶和核糖核酸酶等6个核酸酶.它们可能参与宿主植物遗传物质的降解,干扰宿主遗传代谢,进一步在宿主植物侵染过程中起到重要作用.此外还识别了超氧化物歧化酶、过氧化氢酶和谷胱甘肽S-转移酶等4个抗氧化酶.它们可能参与活性氧的清除以保护固氮酶,是该菌固氮过程的重要参与者.
為瞭穫取莖瘤固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans ORS571)的分泌蛋白,以便更深入地瞭解該菌的共生固氮作用,本研究採用SignalP、TMHMM、PSORTb、TargetP、LipoP、TatP和SecretomeP軟件對該菌全部4 717箇蛋白序列進行分析預測.結果共識彆瞭653箇分泌蛋白,其中具有分泌型信號肽的蛋白54箇,具有RR-motif型信號肽的蛋白1箇,具有脂蛋白信號肽的蛋白2箇和非經典分泌蛋白596箇.該菌含信號肽分泌蛋白僅佔全部蛋白的1.2%,低于其它固氮菌.在分泌蛋白中識彆瞭覈痠內切酶和覈糖覈痠酶等6箇覈痠酶.它們可能參與宿主植物遺傳物質的降解,榦擾宿主遺傳代謝,進一步在宿主植物侵染過程中起到重要作用.此外還識彆瞭超氧化物歧化酶、過氧化氫酶和穀胱甘肽S-轉移酶等4箇抗氧化酶.它們可能參與活性氧的清除以保護固氮酶,是該菌固氮過程的重要參與者.
위료획취경류고담근류균(Azorhizobium caulinodans ORS571)적분비단백,이편경심입지료해해균적공생고담작용,본연구채용SignalP、TMHMM、PSORTb、TargetP、LipoP、TatP화SecretomeP연건대해균전부4 717개단백서렬진행분석예측.결과공식별료653개분비단백,기중구유분비형신호태적단백54개,구유RR-motif형신호태적단백1개,구유지단백신호태적단백2개화비경전분비단백596개.해균함신호태분비단백부점전부단백적1.2%,저우기타고담균.재분비단백중식별료핵산내절매화핵당핵산매등6개핵산매.타문가능삼여숙주식물유전물질적강해,간우숙주유전대사,진일보재숙주식물침염과정중기도중요작용.차외환식별료초양화물기화매、과양화경매화곡광감태S-전이매등4개항양화매.타문가능삼여활성양적청제이보호고담매,시해균고담과정적중요삼여자.
