江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
6期
14-23
,共10页
刘更森%张演义%戴洪义%宋伟
劉更森%張縯義%戴洪義%宋偉
류경삼%장연의%대홍의%송위
苹果%NAC基因家族%氨基酸序列%生物信息学
蘋果%NAC基因傢族%氨基痠序列%生物信息學
평과%NAC기인가족%안기산서렬%생물신식학
NAC转录因子是植物特有的且具有多种生物功能的一类重要转录因子,该家族转录因子广泛参与植物生长发育以及器官建成、逆境胁迫应答等反应.首先利用生物信息学方法对苹果256条NAC蛋白序列的系统发生和NAC基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级结构和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥NAC转录因子家族之间的联系.结果显示苹果256条蛋白序列与拟南芥94条NAC蛋白序列一起被分成了 23个亚族,拟南芥与苹果MC基因间具有较高的保守性.基因组定位结果显示苹果256条MAC基因分布在17条染色体上.研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列疏水性存在一定的差异;二级结构预测分析发现,256条氨基酸序列以随机卷曲为主要组成部分,且256条氨基酸序列三维结构相似.本试验结果将为苹果NAC转录因子家族的进一步功能分析提供重要研究基础.
NAC轉錄因子是植物特有的且具有多種生物功能的一類重要轉錄因子,該傢族轉錄因子廣汎參與植物生長髮育以及器官建成、逆境脅迫應答等反應.首先利用生物信息學方法對蘋果256條NAC蛋白序列的繫統髮生和NAC基因組定位進行分析,然後對其氨基痠組成成分、理化性質以及二級結構和三級結構進行預測和分析,同時還分析瞭蘋果與擬南芥NAC轉錄因子傢族之間的聯繫.結果顯示蘋果256條蛋白序列與擬南芥94條NAC蛋白序列一起被分成瞭 23箇亞族,擬南芥與蘋果MC基因間具有較高的保守性.基因組定位結果顯示蘋果256條MAC基因分佈在17條染色體上.研究還髮現不同亞族間氨基痠數目、氨基痠序列疏水性存在一定的差異;二級結構預測分析髮現,256條氨基痠序列以隨機捲麯為主要組成部分,且256條氨基痠序列三維結構相似.本試驗結果將為蘋果NAC轉錄因子傢族的進一步功能分析提供重要研究基礎.
NAC전록인자시식물특유적차구유다충생물공능적일류중요전록인자,해가족전록인자엄범삼여식물생장발육이급기관건성、역경협박응답등반응.수선이용생물신식학방법대평과256조NAC단백서렬적계통발생화NAC기인조정위진행분석,연후대기안기산조성성분、이화성질이급이급결구화삼급결구진행예측화분석,동시환분석료평과여의남개NAC전록인자가족지간적련계.결과현시평과256조단백서렬여의남개94조NAC단백서렬일기피분성료 23개아족,의남개여평과MC기인간구유교고적보수성.기인조정위결과현시평과256조MAC기인분포재17조염색체상.연구환발현불동아족간안기산수목、안기산서렬소수성존재일정적차이;이급결구예측분석발현,256조안기산서렬이수궤권곡위주요조성부분,차256조안기산서렬삼유결구상사.본시험결과장위평과NAC전록인자가족적진일보공능분석제공중요연구기출.