CAJ | 학술논문

目的通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A * 0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础.方法利用基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法PAProc及基于肽MHC-Ⅰ结合的算法BIMAS和SYFPEITHI对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测;合成KM-HN-1相关候选表位肽KM-HN-1321-329(KLLPFRETV),KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV),KM-HN-1629-637(TLLQIIETV),KM-HN-187-95(ILNKSIIEV),KM-HN-1538-546(QMMEALDQL)及阳性对照肽HBVcAg18-27(FLPSDFFPSV);对这些合成肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及其复合物稳定性根据文献报道的方法进行分析.结果 KM-HN-1321-329(KLLPFRETV)结合亲和力最低,KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV)结合亲和力最高,其余3条肽结合亲和力介于2者之间;稳定性实验(DC50)结果显示:KM-HN-1538-546(QMMEALDQL)DC50小于2 h,KM-HN-1321-329(KLLPFRETV)的DC50介于2～4 h之间,KM-HN-187-95(ILNKSIIEV)的DC50介于6～8 h之间,KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV)及KM-HN-1629-637(TLLQIITV)的DC50均大于8 h.结论基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法及基于肽MHC-Ⅰ结合的算法对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,结合候选表位肽与HLA-A*0201分子结合的亲和力与复合物稳定性实验分析,为该抗原HLA-A*0201限制性表位的鉴定奠定了基础.
목적 통과대CT항원(cancer-testis antigen)KM-HN-1진행HLA-A * 0201한제성표위예측,병대후선표위태여HLA-A*0201분자결합친화력급복합물은정성진행분석,위탐색기우KM-HN-1적면역치료전정기출.방법 이용기우단백매체전절위점특이성적산법PAProc급기우태MHC-Ⅰ결합적산법BIMAS화SYFPEITHI대KM-HN-1진행HLA-A*0201한제성표위예측;합성KM-HN-1상관후선표위태KM-HN-1321-329(KLLPFRETV),KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV),KM-HN-1629-637(TLLQIIETV),KM-HN-187-95(ILNKSIIEV),KM-HN-1538-546(QMMEALDQL)급양성대조태HBVcAg18-27(FLPSDFFPSV);대저사합성태여HLA-A*0201분자결합친화력급기복합물은정성근거문헌보도적방법진행분석.결과 KM-HN-1321-329(KLLPFRETV)결합친화력최저,KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV)결합친화력최고,기여3조태결합친화력개우2자지간;은정성실험(DC50)결과현시:KM-HN-1538-546(QMMEALDQL)DC50소우2 h,KM-HN-1321-329(KLLPFRETV)적DC50개우2～4 h지간,KM-HN-187-95(ILNKSIIEV)적DC50개우6～8 h지간,KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV)급KM-HN-1629-637(TLLQIITV)적DC50균대우8 h.결론 기우단백매체전절위점특이성적산법급기우태MHC-Ⅰ결합적산법대KM-HN-1진행HLA-A*0201한제성표위예측,결합후선표위태여HLA-A*0201분자결합적친화력여복합물은정성실험분석,위해항원HLA-A*0201한제성표위적감정전정료기출.