肠道病毒71型中国西安分离株全基因组核苷酸序列分析
장도병독71형중국서안분리주전기인조핵감산서렬분석
Complete Sequence Analysis of Enterovirus 71 XA87-2008 Isolate from Xi'an,China
  • 万方数据
    现代检验医学杂志 현대검험의학잡지
    JOURNAL OF MODERN LABORATORY MEDICINE
    2010年 4期 16-18 ,共3页

    卢晓玲%郑海潮%杜全丽%黄银娟%李一为%杨扬%李亚蓉%马超锋

    로효령%정해조%두전려%황은연%리일위%양양%리아용%마초봉

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    장도병독71형%서렬분석%동원성분석%계통진화
    目的 分析肠道病毒71型西安分离株(XA87-2008)全基因组核苷酸序列特征.方法 参考相关毒株序列,设计7对可重叠扩增全基因组的引物.提取一株2008年分离自西安市儿童医院手足口病病例标本的病毒基因组RNA,合成cDNA,进而扩增出7个目的片段,插入T载体克隆,对阳性克隆测序.利用MegAlign进行同源性分析,MEGA4软件进行进化分析.结果 XA87-2008毒株基因组全序7 414 bp,同源性分析与安徽阜阳2008年毒株高度同源,与其它基因亚型相差较大;进化分析显示其VP1区和全基因组序列均与C4基因亚型在同一进化支.结论 XA87-2008毒株为C4亚型,在进化关系上与近年来中国大陆流行株关系密切.
    목적 분석장도병독71형서안분리주(XA87-2008)전기인조핵감산서렬특정.방법 삼고상관독주서렬,설계7대가중첩확증전기인조적인물.제취일주2008년분리자서안시인동의원수족구병병례표본적병독기인조RNA,합성cDNA,진이확증출7개목적편단,삽입T재체극륭,대양성극륭측서.이용MegAlign진행동원성분석,MEGA4연건진행진화분석.결과 XA87-2008독주기인조전서7 414 bp,동원성분석여안휘부양2008년독주고도동원,여기타기인아형상차교대;진화분석현시기VP1구화전기인조서렬균여C4기인아형재동일진화지.결론 XA87-2008독주위C4아형,재진화관계상여근년래중국대륙류행주관계밀절.
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