生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2004年
4期
10-14
,共5页
翁景然%张宏%耿美英%张成岗
翁景然%張宏%耿美英%張成崗
옹경연%장굉%경미영%장성강
真核基因%cDNA序列%起始密码子%终止密码子%序列特征%Kozak规则
真覈基因%cDNA序列%起始密碼子%終止密碼子%序列特徵%Kozak規則
진핵기인%cDNA서렬%기시밀마자%종지밀마자%서렬특정%Kozak규칙
真核基因起始与终止密码子旁侧序列的特征对于确定cDNA开放阅读框架(ORF)和预测基因组序列中的编码区(CDS)非常重要.基于高质量RefSeq数据库,在较大数据规模下统计分析了起始密码子旁侧序列所具有的"Kozak规则",发现不同物种之间存在差别.同时分析了不同终止密码子旁侧序列的统计学特征,给出了相应的正则表达式.由于发现多种基因中存在同相位起始、终止密码子串联使用的情况,亦对此进行了讨论.
真覈基因起始與終止密碼子徬側序列的特徵對于確定cDNA開放閱讀框架(ORF)和預測基因組序列中的編碼區(CDS)非常重要.基于高質量RefSeq數據庫,在較大數據規模下統計分析瞭起始密碼子徬側序列所具有的"Kozak規則",髮現不同物種之間存在差彆.同時分析瞭不同終止密碼子徬側序列的統計學特徵,給齣瞭相應的正則錶達式.由于髮現多種基因中存在同相位起始、終止密碼子串聯使用的情況,亦對此進行瞭討論.
진핵기인기시여종지밀마자방측서렬적특정대우학정cDNA개방열독광가(ORF)화예측기인조서렬중적편마구(CDS)비상중요.기우고질량RefSeq수거고,재교대수거규모하통계분석료기시밀마자방측서렬소구유적"Kozak규칙",발현불동물충지간존재차별.동시분석료불동종지밀마자방측서렬적통계학특정,급출료상응적정칙표체식.유우발현다충기인중존재동상위기시、종지밀마자천련사용적정황,역대차진행료토론.