CAJ | 학술논문

在破译了基因序列的后基因组时代,随着系统生物学实验的快速发展,产生了大量的蛋白质相互作用数据,利用这些数据寻找功能模块及预测蛋白质功能在功能基因组研究中具有重要意义.打破了传统的基于蛋白质间相似度的聚类模式,直接从蛋白质功能团的角度出发,考虑功能团间的一阶和二阶相互作用,提出了模块化聚类方法(MCM),对实验数据进行聚类分析,来预测模块内未知蛋白质的功能.通过超几何分布P值法和增、删、改相互作用的方法对聚类结果进行预测能力分析和稳定性分析.结果表明,模块化聚类方法具有较高的预测准确度和覆盖率,有很好的容错性和稳定性.此外,模块化聚类分析得到了一些具有高预测准确度的未知蛋白质的预测结果,将会对生物实验有指导意义,其算法对其他具有相似结构的网络也具有普遍意义.
재파역료기인서렬적후기인조시대,수착계통생물학실험적쾌속발전,산생료대량적단백질상호작용수거,이용저사수거심조공능모괴급예측단백질공능재공능기인조연구중구유중요의의.타파료전통적기우단백질간상사도적취류모식,직접종단백질공능단적각도출발,고필공능단간적일계화이계상호작용,제출료모괴화취류방법(MCM),대실험수거진행취류분석,래예측모괴내미지단백질적공능.통과초궤하분포P치법화증、산、개상호작용적방법대취류결과진행예측능력분석화은정성분석.결과표명,모괴화취류방법구유교고적예측준학도화복개솔,유흔호적용착성화은정성.차외,모괴화취류분석득도료일사구유고예측준학도적미지단백질적예측결과,장회대생물실험유지도의의,기산법대기타구유상사결구적망락야구유보편의의.