畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2012年
3期
438-445
,共8页
周伦江%车勇良%陈如敬%江斌%王隆柏%魏宏%吴学敏%庄向生
週倫江%車勇良%陳如敬%江斌%王隆柏%魏宏%吳學敏%莊嚮生
주륜강%차용량%진여경%강빈%왕륭백%위굉%오학민%장향생
副猪嗜血杆菌%肽聚糖相关脂蛋白%序列分析%同源建模
副豬嗜血桿菌%肽聚糖相關脂蛋白%序列分析%同源建模
부저기혈간균%태취당상관지단백%서렬분석%동원건모
为深入研究副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)肽聚糖相关脂蛋白(Peptidoglycan-associated lipoprotein,palA)的生物学特性,设计了一对特异性引物,应用PCR方法来扩增Hps palA的全基因序列,进行克隆和测序.采用生物信息学方法,对Hps的palA基因核苷酸及其编码氨基酸序列进行比对,选取其中的血清学5型分离株,对其PalA蛋白的分子结构、理化性质及结构功能域、蛋白质二级结构等重要参数进行了预测和分析,并对PalA蛋白的三级结构进行了同源建模.结果显示,PCR扩增出462 bp的目的片段；测序结果显示出不同血清型Hps之间palA基因核苷酸序列相似性有一定的差异,而所对应的氨基酸序列却差异很小；密码子偏爱性分析表明palA基因主要偏好GCA和AAA; PalA蛋白的理论等电点为6.28,偏弱酸性；PalA蛋白的二级结构以α螺旋、不规则卷曲和延伸链为主要构件；Hps的PalA蛋白的氨基酸序列与流感嗜血杆菌Pal蛋白的相似性为71.97％,以Pal蛋白结构为模板成功构建了Hps的PalA蛋白三维结构分子模型,该PalA蛋白三维结构与Pal蛋白相似,也含有肽聚糖结合口袋区,主要由第80位的酪氨酸( Tyr)、第39位的苯丙氨酸(Phe)和第84位的亮氨酸(Leu)组成.Hps的PalA蛋白的成功建模为PalA蛋白功能的深入研究提供了参考依据.
為深入研究副豬嗜血桿菌(Haemophilus parasuis,Hps)肽聚糖相關脂蛋白(Peptidoglycan-associated lipoprotein,palA)的生物學特性,設計瞭一對特異性引物,應用PCR方法來擴增Hps palA的全基因序列,進行剋隆和測序.採用生物信息學方法,對Hps的palA基因覈苷痠及其編碼氨基痠序列進行比對,選取其中的血清學5型分離株,對其PalA蛋白的分子結構、理化性質及結構功能域、蛋白質二級結構等重要參數進行瞭預測和分析,併對PalA蛋白的三級結構進行瞭同源建模.結果顯示,PCR擴增齣462 bp的目的片段；測序結果顯示齣不同血清型Hps之間palA基因覈苷痠序列相似性有一定的差異,而所對應的氨基痠序列卻差異很小；密碼子偏愛性分析錶明palA基因主要偏好GCA和AAA; PalA蛋白的理論等電點為6.28,偏弱痠性；PalA蛋白的二級結構以α螺鏇、不規則捲麯和延伸鏈為主要構件；Hps的PalA蛋白的氨基痠序列與流感嗜血桿菌Pal蛋白的相似性為71.97％,以Pal蛋白結構為模闆成功構建瞭Hps的PalA蛋白三維結構分子模型,該PalA蛋白三維結構與Pal蛋白相似,也含有肽聚糖結閤口袋區,主要由第80位的酪氨痠( Tyr)、第39位的苯丙氨痠(Phe)和第84位的亮氨痠(Leu)組成.Hps的PalA蛋白的成功建模為PalA蛋白功能的深入研究提供瞭參攷依據.
위심입연구부저기혈간균(Haemophilus parasuis,Hps)태취당상관지단백(Peptidoglycan-associated lipoprotein,palA)적생물학특성,설계료일대특이성인물,응용PCR방법래확증Hps palA적전기인서렬,진행극륭화측서.채용생물신식학방법,대Hps적palA기인핵감산급기편마안기산서렬진행비대,선취기중적혈청학5형분리주,대기PalA단백적분자결구、이화성질급결구공능역、단백질이급결구등중요삼수진행료예측화분석,병대PalA단백적삼급결구진행료동원건모.결과현시,PCR확증출462 bp적목적편단；측서결과현시출불동혈청형Hps지간palA기인핵감산서렬상사성유일정적차이,이소대응적안기산서렬각차이흔소；밀마자편애성분석표명palA기인주요편호GCA화AAA; PalA단백적이론등전점위6.28,편약산성；PalA단백적이급결구이α라선、불규칙권곡화연신련위주요구건；Hps적PalA단백적안기산서렬여류감기혈간균Pal단백적상사성위71.97％,이Pal단백결구위모판성공구건료Hps적PalA단백삼유결구분자모형,해PalA단백삼유결구여Pal단백상사,야함유태취당결합구대구,주요유제80위적락안산( Tyr)、제39위적분병안산(Phe)화제84위적량안산(Leu)조성.Hps적PalA단백적성공건모위PalA단백공능적심입연구제공료삼고의거.
