海洋通报（英文版）
海洋通報（英文版）
해양통보（영문판）
MARINE SCIENCE BULLETIN
2010年
1期
59-64
,共6页
虾青素%顺式作用元件%5'上游侧翼学列%雨生红球藻%crtO
蝦青素%順式作用元件%5'上遊側翼學列%雨生紅毬藻%crtO
하청소%순식작용원건%5'상유측익학렬%우생홍구조%crtO
astaxanthin%cis-acting elements%crtO%5'-flanking region%Haematococcus pluvialis
在本研究中,我们首次通过基因组上游第一次步移克隆到了雨生红球藻中crtO基因的3个不同大小的5'上游侧翼序列1.1 kb,1.9 kb和 2.2 kb.利用生物信息学方法分别预测并比较了这3个不同大小的5'上游侧翼序列,结果发现,三者具有与高等植物相类似的顺式作用元件,如脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G-box, GAG-motif,I-box and ATC-motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBS and MRE)等等,但是三者并不具有典型的TATA框和CCAAT框.上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中crtO基因调控方式的多样化.
在本研究中,我們首次通過基因組上遊第一次步移剋隆到瞭雨生紅毬藻中crtO基因的3箇不同大小的5'上遊側翼序列1.1 kb,1.9 kb和 2.2 kb.利用生物信息學方法分彆預測併比較瞭這3箇不同大小的5'上遊側翼序列,結果髮現,三者具有與高等植物相類似的順式作用元件,如脫落痠反應元件(ABRE)、榦燥或低溫反應元件(DRE/C-repeat)、幾種光反應元件(G-box, GAG-motif,I-box and ATC-motif)、熱激反應元件(HSE)、機械傷害反應元件(WUN-motif)、生長素反應元件(TGA-element)、茉莉痠甲酯反應元件(TGACG-element)和反式作用因子MYB蛋白的結閤位點(MBS and MRE)等等,但是三者併不具有典型的TATA框和CCAAT框.上述研究預示瞭雨生紅毬藻蝦青素閤成中crtO基因調控方式的多樣化.
재본연구중,아문수차통과기인조상유제일차보이극륭도료우생홍구조중crtO기인적3개불동대소적5'상유측익서렬1.1 kb,1.9 kb화 2.2 kb.이용생물신식학방법분별예측병비교료저3개불동대소적5'상유측익서렬,결과발현,삼자구유여고등식물상유사적순식작용원건,여탈락산반응원건(ABRE)、간조혹저온반응원건(DRE/C-repeat)、궤충광반응원건(G-box, GAG-motif,I-box and ATC-motif)、열격반응원건(HSE)、궤계상해반응원건(WUN-motif)、생장소반응원건(TGA-element)、말리산갑지반응원건(TGACG-element)화반식작용인자MYB단백적결합위점(MBS and MRE)등등,단시삼자병불구유전형적TATA광화CCAAT광.상술연구예시료우생홍구조하청소합성중crtO기인조공방식적다양화.
Three separate 5'-flanking regions (1.1 kb, 1.9 kb and 2.2 kb) of crtO were cloned through walking upstream. Results of sequence analysis show that three 5'-flanking regions of crtO might have some similar putative cis-acting elements such as ABA (abscisic acid)-responsive element (ABRE), C-repeat/dehydration responsive element (C-repeat/DRE), light-responsive element (G-box, GAG-motif, I-box and ATC-motif), wound-responsive element (WUN-motif), auxin-responsive element (TGA-element), MeJA-responsive element (TGACG-element) and MYB binding site (MBS), except for typical TATA box or CCAAT box. These findings might mean diversiform regulatory patterns of crtO being in astaxanthin biosynthesis of Haematococcus pluvialis.
