中华微生物学和免疫学杂志
中華微生物學和免疫學雜誌
중화미생물학화면역학잡지
CHINESE JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
2006年
4期
339-342
,共4页
蒋盛军%纪绍忠%唐青%杨红彦%崔晓英%毕烨%阚飙%高守一
蔣盛軍%紀紹忠%唐青%楊紅彥%崔曉英%畢燁%闞飆%高守一
장성군%기소충%당청%양홍언%최효영%필엽%감표%고수일
新的成人腹泻轮状病毒%J19株%基因%克隆%序列分析
新的成人腹瀉輪狀病毒%J19株%基因%剋隆%序列分析
신적성인복사륜상병독%J19주%기인%극륭%서렬분석
目的克隆新的成人腹泻轮状病毒J19株NSP4和NSP5基因,并分析其基因序列.方法利用一种改进的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株NSP4和NSP5基因,克隆到pMD18-T载体中并进行测序.在此基础上,将J19株NSP4和NSP5的蛋白序列与其他轮状病毒蛋白序列进行比较分析和种系进化分析.结果J19株NSP4和NSP5基因为基因10和11,全长为739 bp和649 bp,它们分别编码213个和176个氨基酸.与J19株NSP4和NSP5蛋白序列一致性较高的分别是B组成人腹泻轮状病毒Bang373株(20.3%)和B组猪轮状病毒db101株(29.5%).对J19株的NSP4和NSP5的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置都靠近A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向B组轮状病毒的分支.结论J19株的NSP4和NSP5与其他轮状病毒的相应蛋白序列存在显著差异.J19株NSP4和NSP5的蛋白序列比较和遗传进化分析表明新的成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒可能有共同起源;但是新的成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒存在显著差异.
目的剋隆新的成人腹瀉輪狀病毒J19株NSP4和NSP5基因,併分析其基因序列.方法利用一種改進的非依賴覈痠序列的單引物擴增方法擴增J19株NSP4和NSP5基因,剋隆到pMD18-T載體中併進行測序.在此基礎上,將J19株NSP4和NSP5的蛋白序列與其他輪狀病毒蛋白序列進行比較分析和種繫進化分析.結果J19株NSP4和NSP5基因為基因10和11,全長為739 bp和649 bp,它們分彆編碼213箇和176箇氨基痠.與J19株NSP4和NSP5蛋白序列一緻性較高的分彆是B組成人腹瀉輪狀病毒Bang373株(20.3%)和B組豬輪狀病毒db101株(29.5%).對J19株的NSP4和NSP5的遺傳進化分析錶明,J19株在進化樹上的位置都靠近A、B和C組輪狀病毒分支的根部,而且它比較偏嚮B組輪狀病毒的分支.結論J19株的NSP4和NSP5與其他輪狀病毒的相應蛋白序列存在顯著差異.J19株NSP4和NSP5的蛋白序列比較和遺傳進化分析錶明新的成人腹瀉輪狀病毒與成人腹瀉輪狀病毒可能有共同起源;但是新的成人腹瀉輪狀病毒與成人腹瀉輪狀病毒存在顯著差異.
목적극륭신적성인복사륜상병독J19주NSP4화NSP5기인,병분석기기인서렬.방법이용일충개진적비의뢰핵산서렬적단인물확증방법확증J19주NSP4화NSP5기인,극륭도pMD18-T재체중병진행측서.재차기출상,장J19주NSP4화NSP5적단백서렬여기타륜상병독단백서렬진행비교분석화충계진화분석.결과J19주NSP4화NSP5기인위기인10화11,전장위739 bp화649 bp,타문분별편마213개화176개안기산.여J19주NSP4화NSP5단백서렬일치성교고적분별시B조성인복사륜상병독Bang373주(20.3%)화B조저륜상병독db101주(29.5%).대J19주적NSP4화NSP5적유전진화분석표명,J19주재진화수상적위치도고근A、B화C조륜상병독분지적근부,이차타비교편향B조륜상병독적분지.결론J19주적NSP4화NSP5여기타륜상병독적상응단백서렬존재현저차이.J19주NSP4화NSP5적단백서렬비교화유전진화분석표명신적성인복사륜상병독여성인복사륜상병독가능유공동기원;단시신적성인복사륜상병독여성인복사륜상병독존재현저차이.
