基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2011年
3期
379-384
,共6页
崔亚茹%张坤山%罗玉萍%李思光
崔亞茹%張坤山%囉玉萍%李思光
최아여%장곤산%라옥평%리사광
基因簇%miR-302%分子进化
基因簇%miR-302%分子進化
기인족%miR-302%분자진화
很多microRNA (miRNA)基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇.miRNA基因簇在进化上较为保守,有其特殊的生物学意义.miR-302基因簇在胚胎干细胞中特异表达,对胚胎干细胞的自我更新和多潜能维持有重要的作用.本文采用miRBase数据库查询和BLAST同源搜索方法共搜寻并分析了12个物种的miR-302基因簇.生物信息学分析表明,这些物种miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的内含子区,但转录方向与LARP7基因转录方向相反.序列相似性分析显示,同一物种miR-302簇成员间以及不同物种相应miR-302簇成员间相似性均较高.进化分析表明,基因复制可能是miR-302基因簇进化的主要驱动力.
很多microRNA (miRNA)基因在基因組上聚集排列形成miRNA基因簇.miRNA基因簇在進化上較為保守,有其特殊的生物學意義.miR-302基因簇在胚胎榦細胞中特異錶達,對胚胎榦細胞的自我更新和多潛能維持有重要的作用.本文採用miRBase數據庫查詢和BLAST同源搜索方法共搜尋併分析瞭12箇物種的miR-302基因簇.生物信息學分析錶明,這些物種miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的內含子區,但轉錄方嚮與LARP7基因轉錄方嚮相反.序列相似性分析顯示,同一物種miR-302簇成員間以及不同物種相應miR-302簇成員間相似性均較高.進化分析錶明,基因複製可能是miR-302基因簇進化的主要驅動力.
흔다microRNA (miRNA)기인재기인조상취집배렬형성miRNA기인족.miRNA기인족재진화상교위보수,유기특수적생물학의의.miR-302기인족재배태간세포중특이표체,대배태간세포적자아경신화다잠능유지유중요적작용.본문채용miRBase수거고사순화BLAST동원수색방법공수심병분석료12개물충적miR-302기인족.생물신식학분석표명,저사물충miR-302기인족균위우LARP7단백기인적내함자구,단전록방향여LARP7기인전록방향상반.서렬상사성분석현시,동일물충miR-302족성원간이급불동물충상응miR-302족성원간상사성균교고.진화분석표명,기인복제가능시miR-302기인족진화적주요구동력.
