天津医药
天津醫藥
천진의약
TIANJIN MEDICAL JOURNAL
2010年
11期
940-943
,共4页
谢彤%巨韩芳%赵德福%穆成%赵慧%吴振萍%王撷秀
謝彤%巨韓芳%趙德福%穆成%趙慧%吳振萍%王擷秀
사동%거한방%조덕복%목성%조혜%오진평%왕힐수
分枝杆菌,结核%串联重复序列%基因型%多态现象,遗传%流行病学,分子%天津
分枝桿菌,結覈%串聯重複序列%基因型%多態現象,遺傳%流行病學,分子%天津
분지간균,결핵%천련중복서렬%기인형%다태현상,유전%류행병학,분자%천진
目的:分析天津地区流行结核分枝杆菌(MTB)基因组中分布的可变串联重复序列(VNTR)拷贝数目多态性,探讨不同MTB菌株分辨能力强的VNTR基因分型方法.方法:根据VNTR位点PCR扩增产物片段长度分析临床分离的102株MTB菌基因组中22个VNTR位点中重复序列拷贝数目,使用Hunter-Gaston分辨指数(H)评估各个VNTB位点的多态性和VNTR基因分型方法对菌株的综合辨别能力.结果:13个VNTR位点对不同MTB菌株具有较强的分辨能力,其分辨指数达0.9963.其中QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31和Mtub21的多态性较好(H值为0.442~0.699);MIRU-10、27、39、40,QUB1895和ETR-A位点的多态性尚可(H值为0.203~0.316);而MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B和C的多态性差(H值为0.000~0.150),其中MIRU-2、20、24和QUB1451在北京家族菌株中没有多态性(H=0).结论:选择多态性好的位点组合可以有效地区分不同的MTB北京家族菌株,建立起菌株分辨能力强的VNTR分型方法.
目的:分析天津地區流行結覈分枝桿菌(MTB)基因組中分佈的可變串聯重複序列(VNTR)拷貝數目多態性,探討不同MTB菌株分辨能力彊的VNTR基因分型方法.方法:根據VNTR位點PCR擴增產物片段長度分析臨床分離的102株MTB菌基因組中22箇VNTR位點中重複序列拷貝數目,使用Hunter-Gaston分辨指數(H)評估各箇VNTB位點的多態性和VNTR基因分型方法對菌株的綜閤辨彆能力.結果:13箇VNTR位點對不同MTB菌株具有較彊的分辨能力,其分辨指數達0.9963.其中QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31和Mtub21的多態性較好(H值為0.442~0.699);MIRU-10、27、39、40,QUB1895和ETR-A位點的多態性尚可(H值為0.203~0.316);而MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B和C的多態性差(H值為0.000~0.150),其中MIRU-2、20、24和QUB1451在北京傢族菌株中沒有多態性(H=0).結論:選擇多態性好的位點組閤可以有效地區分不同的MTB北京傢族菌株,建立起菌株分辨能力彊的VNTR分型方法.
목적:분석천진지구류행결핵분지간균(MTB)기인조중분포적가변천련중복서렬(VNTR)고패수목다태성,탐토불동MTB균주분변능력강적VNTR기인분형방법.방법:근거VNTR위점PCR확증산물편단장도분석림상분리적102주MTB균기인조중22개VNTR위점중중복서렬고패수목,사용Hunter-Gaston분변지수(H)평고각개VNTB위점적다태성화VNTR기인분형방법대균주적종합변별능력.결과:13개VNTR위점대불동MTB균주구유교강적분변능력,기분변지수체0.9963.기중QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31화Mtub21적다태성교호(H치위0.442~0.699);MIRU-10、27、39、40,QUB1895화ETR-A위점적다태성상가(H치위0.203~0.316);이MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B화C적다태성차(H치위0.000~0.150),기중MIRU-2、20、24화QUB1451재북경가족균주중몰유다태성(H=0).결론:선택다태성호적위점조합가이유효지구분불동적MTB북경가족균주,건립기균주분변능력강적VNTR분형방법.