南京林业大学学报(自然科学版)
南京林業大學學報(自然科學版)
남경임업대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF NANJING FORESTRY UNIVERSITY
2008年
5期
61-64
,共4页
单文娟%周猛%卫巍%童春发%施季森
單文娟%週猛%衛巍%童春髮%施季森
단문연%주맹%위외%동춘발%시계삼
杨树%AUG侧翼序列%保守性%关联性%ACGCAI值
楊樹%AUG側翼序列%保守性%關聯性%ACGCAI值
양수%AUG측익서렬%보수성%관련성%ACGCAI치
对297条杨树基因序列的起始密码子AUG侧翼区序列(-20位点-+6位点)的碱基分布特性进行了统计学分析,并对高表达基因和低表达基因翻译起始位点侧翼序列碱基的保守性和关联性进行了对比分析.结果表明:紧邻起始密码子5'端的-1、-2、-3、-4、-5和-6位点均强烈偏好A,+4位点强烈偏好G,同时高表达和低表达基因的-20位到+4位中某些位点的保守性存在较大差异,其中高表达基因的-6,-3和+4位可能与其高表达的特性有关;通过关联性分析可以看出,在起始密码子侧翼序列的某些特定区域碱基之间的关联性可能也与翻译起始效率有关系;相关性分析表明低表达基因的ACGCAI主要受到"AUG侧翼区"序列的GC含量的影响,低表达基因在AUG侧翼区富集GC对翻译有一定影响.
對297條楊樹基因序列的起始密碼子AUG側翼區序列(-20位點-+6位點)的堿基分佈特性進行瞭統計學分析,併對高錶達基因和低錶達基因翻譯起始位點側翼序列堿基的保守性和關聯性進行瞭對比分析.結果錶明:緊鄰起始密碼子5'耑的-1、-2、-3、-4、-5和-6位點均彊烈偏好A,+4位點彊烈偏好G,同時高錶達和低錶達基因的-20位到+4位中某些位點的保守性存在較大差異,其中高錶達基因的-6,-3和+4位可能與其高錶達的特性有關;通過關聯性分析可以看齣,在起始密碼子側翼序列的某些特定區域堿基之間的關聯性可能也與翻譯起始效率有關繫;相關性分析錶明低錶達基因的ACGCAI主要受到"AUG側翼區"序列的GC含量的影響,低錶達基因在AUG側翼區富集GC對翻譯有一定影響.
대297조양수기인서렬적기시밀마자AUG측익구서렬(-20위점-+6위점)적감기분포특성진행료통계학분석,병대고표체기인화저표체기인번역기시위점측익서렬감기적보수성화관련성진행료대비분석.결과표명:긴린기시밀마자5'단적-1、-2、-3、-4、-5화-6위점균강렬편호A,+4위점강렬편호G,동시고표체화저표체기인적-20위도+4위중모사위점적보수성존재교대차이,기중고표체기인적-6,-3화+4위가능여기고표체적특성유관;통과관련성분석가이간출,재기시밀마자측익서렬적모사특정구역감기지간적관련성가능야여번역기시효솔유관계;상관성분석표명저표체기인적ACGCAI주요수도"AUG측익구"서렬적GC함량적영향,저표체기인재AUG측익구부집GC대번역유일정영향.
