中山大学学报(自然科学版)
中山大學學報(自然科學版)
중산대학학보(자연과학판)
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS SUNYATSENI
2001年
5期
83-87
,共5页
刘泽寰%林蒋海%符志彦%潘德京%徐安龙
劉澤寰%林蔣海%符誌彥%潘德京%徐安龍
류택환%림장해%부지언%반덕경%서안룡
基因分型%基于序列的分型%测序%HLA_DPB1
基因分型%基于序列的分型%測序%HLA_DPB1
기인분형%기우서렬적분형%측서%HLA_DPB1
设计了一种自动化的基因分型方法,能够直接利用PCR产物的DNA测序结果作为数据, 通过自动化基因分型程序(automatic genotyping program)与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较,来完成高精度的基因分型工作.用这种方法对50个随机挑选的中国南方人的HLA-DPB1基因进行了基因分型,证明该方法是可行的,并从中发现了2个不明确杂合子以及一个新的等位基因序列.随后对这些样品克隆测序,发现除了2个不明确杂合子得到了进一步的区分外,其它样品都与前面的分型结果一致,显示了96%的精确性.通过以上的研究表明,成功建立了一种高精度的、基于序列的分型(sequence-based typing) 方法.既然该方法能成功分型HLA-DPB1基因,预示了该方法同样能应用于其它基因的分型.该AGP程序可以在http:/genome.zsu.edu.cn免费下载.
設計瞭一種自動化的基因分型方法,能夠直接利用PCR產物的DNA測序結果作為數據, 通過自動化基因分型程序(automatic genotyping program)與一箇含有其等位基因序列的數據庫進行比較,來完成高精度的基因分型工作.用這種方法對50箇隨機挑選的中國南方人的HLA-DPB1基因進行瞭基因分型,證明該方法是可行的,併從中髮現瞭2箇不明確雜閤子以及一箇新的等位基因序列.隨後對這些樣品剋隆測序,髮現除瞭2箇不明確雜閤子得到瞭進一步的區分外,其它樣品都與前麵的分型結果一緻,顯示瞭96%的精確性.通過以上的研究錶明,成功建立瞭一種高精度的、基于序列的分型(sequence-based typing) 方法.既然該方法能成功分型HLA-DPB1基因,預示瞭該方法同樣能應用于其它基因的分型.該AGP程序可以在http:/genome.zsu.edu.cn免費下載.
설계료일충자동화적기인분형방법,능구직접이용PCR산물적DNA측서결과작위수거, 통과자동화기인분형정서(automatic genotyping program)여일개함유기등위기인서렬적수거고진행비교,래완성고정도적기인분형공작.용저충방법대50개수궤도선적중국남방인적HLA-DPB1기인진행료기인분형,증명해방법시가행적,병종중발현료2개불명학잡합자이급일개신적등위기인서렬.수후대저사양품극륭측서,발현제료2개불명학잡합자득도료진일보적구분외,기타양품도여전면적분형결과일치,현시료96%적정학성.통과이상적연구표명,성공건립료일충고정도적、기우서렬적분형(sequence-based typing) 방법.기연해방법능성공분형HLA-DPB1기인,예시료해방법동양능응용우기타기인적분형.해AGP정서가이재http:/genome.zsu.edu.cn면비하재.
