CAJ | 학술논문

采用生物信息学方法克隆出全长3811bp的人类RC508 cDNA片段,经核酸和蛋白质分析为人类新基因(GenBank 登记号: AF459094),利用RT-PCR方法从人类胰脏组织中扩增出包含编码508个氨基酸残基最大开放读码框架(ORF)的1680bp cDNA片段,经核酸测序证明与电子克隆结果完全一致.该基因具有启动子和TATA-box,ORF前同一相位有多个终子码,后有加尾信号,显示为客观存在基因.该基因含有12个外显子(96～2093bp)和11个内含子(140～5153bp),定位于人类5号染色体5q11.2～q12.1,无任何连锁基因存在.该基因ORF 342～1868(1527)横跨10个外显子,所编码508氨基酸蛋白的全长序列与大鼠丝氨酸-精氨酸二肽富含性(SR)剪切调控蛋白86(SRrp86)高度同源,在核酸和蛋白水平的同源性分别为84%和86%,与其他已知蛋白无论在核酸水平还是在氨基酸水平几乎均无整体的同源性.结果表明,所克隆的508氨基酸蛋白才是大鼠SRrp86的人类同源物,从而修正了Barnard(2000)所指出的人类同源物为人类精氨酸富含性核蛋白54(p54)这一论断,并提示它是日益增长的SR蛋白超家族的又一个新成员.该基因组织表达谱广泛,有可能具有转录因子活性,暂命名为SR相关剪切调控蛋白508(SRrp508).国际人类基因命名委员会已将其命名为丝氨酸-精氨酸二肽富含性剪切因子12(splicing factor, arginine/serine-rich 12),缩写为SFRS12,化名为DKFZp564B176,SRrp86.
채용생물신식학방법극륭출전장3811bp적인류RC508 cDNA편단,경핵산화단백질분석위인류신기인(GenBank 등기호: AF459094),이용RT-PCR방법종인류이장조직중확증출포함편마508개안기산잔기최대개방독마광가(ORF)적1680bp cDNA편단,경핵산측서증명여전자극륭결과완전일치.해기인구유계동자화TATA-box,ORF전동일상위유다개종자마,후유가미신호,현시위객관존재기인.해기인함유12개외현자(96～2093bp)화11개내함자(140～5153bp),정위우인류5호염색체5q11.2～q12.1,무임하련쇄기인존재.해기인ORF 342～1868(1527)횡과10개외현자,소편마508안기산단백적전장서렬여대서사안산-정안산이태부함성(SR)전절조공단백86(SRrp86)고도동원,재핵산화단백수평적동원성분별위84%화86%,여기타이지단백무론재핵산수평환시재안기산수평궤호균무정체적동원성.결과표명,소극륭적508안기산단백재시대서SRrp86적인류동원물,종이수정료Barnard(2000)소지출적인류동원물위인류정안산부함성핵단백54(p54)저일론단,병제시타시일익증장적SR단백초가족적우일개신성원.해기인조직표체보엄범,유가능구유전록인자활성,잠명명위SR상관전절조공단백508(SRrp508).국제인류기인명명위원회이장기명명위사안산-정안산이태부함성전절인자12(splicing factor, arginine/serine-rich 12),축사위SFRS12,화명위DKFZp564B176,SRrp86.