内蒙古大学学报（自然科学版）
內矇古大學學報（自然科學版）
내몽고대학학보（자연과학판）
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NEIMONGOL
2011年
3期
311-317
,共7页
张艳%孙慈%项新媛%左永春%李前忠
張豔%孫慈%項新媛%左永春%李前忠
장염%손자%항신원%좌영춘%리전충
亚线粒体定位%约化组分%伪氨基酸组分%支持向量机
亞線粒體定位%約化組分%偽氨基痠組分%支持嚮量機
아선립체정위%약화조분%위안기산조분%지지향량궤
在Du和Li构建的首个亚线粒体定位数据库基础上,将线粒体蛋白依据亚线粒体位置细分为四大类进行预测.对基于氨基酸的亲疏水特征、物理化学特征和结构特征的蛋白质序列约化信息做出讨论.给出在单肽组分和六类亲疏水约化情形下的蛋白质序列最佳分割位点,结果不仅符合真实生物学现象而且范围更加精确,可为相关实验研究提供参考.提出了最佳组合参数,该参数是ω=0.10,λ=22时亲疏水残基指数值及平行相关形式的伪氨基酸组分结合全序列单肽组分,利用支持向量机算法进行预测,达到了较好的预测结果.利用本文提出的最佳组合参数对未知蛋白序列进行检验,结果显示有一定注释作用,特别是对于Inner membrane类和Matrix类的预测精度较高.
在Du和Li構建的首箇亞線粒體定位數據庫基礎上,將線粒體蛋白依據亞線粒體位置細分為四大類進行預測.對基于氨基痠的親疏水特徵、物理化學特徵和結構特徵的蛋白質序列約化信息做齣討論.給齣在單肽組分和六類親疏水約化情形下的蛋白質序列最佳分割位點,結果不僅符閤真實生物學現象而且範圍更加精確,可為相關實驗研究提供參攷.提齣瞭最佳組閤參數,該參數是ω=0.10,λ=22時親疏水殘基指數值及平行相關形式的偽氨基痠組分結閤全序列單肽組分,利用支持嚮量機算法進行預測,達到瞭較好的預測結果.利用本文提齣的最佳組閤參數對未知蛋白序列進行檢驗,結果顯示有一定註釋作用,特彆是對于Inner membrane類和Matrix類的預測精度較高.
재Du화Li구건적수개아선립체정위수거고기출상,장선립체단백의거아선립체위치세분위사대류진행예측.대기우안기산적친소수특정、물이화학특정화결구특정적단백질서렬약화신식주출토론.급출재단태조분화륙류친소수약화정형하적단백질서렬최가분할위점,결과불부부합진실생물학현상이차범위경가정학,가위상관실험연구제공삼고.제출료최가조합삼수,해삼수시ω=0.10,λ=22시친소수잔기지수치급평행상관형식적위안기산조분결합전서렬단태조분,이용지지향량궤산법진행예측,체도료교호적예측결과.이용본문제출적최가조합삼수대미지단백서렬진행검험,결과현시유일정주석작용,특별시대우Inner membrane류화Matrix류적예측정도교고.
