脑与神经疾病杂志
腦與神經疾病雜誌
뇌여신경질병잡지
JOURNAL OF BRAIN AND NERVOUS DISEASES
2010年
5期
324-332
,共9页
刘卫卫%白欣立%李震中%张军峰%李鑫%赵子春%李春岩
劉衛衛%白訢立%李震中%張軍峰%李鑫%趙子春%李春巖
류위위%백흔립%리진중%장군봉%리흠%조자춘%리춘암
骨髓间充质干细胞%神经元%诱导分化%神经节苷脂园%空肠弯曲菌%克隆%序列分析%B细胞抗原表位
骨髓間充質榦細胞%神經元%誘導分化%神經節苷脂園%空腸彎麯菌%剋隆%序列分析%B細胞抗原錶位
골수간충질간세포%신경원%유도분화%신경절감지완%공장만곡균%극륭%서렬분석%B세포항원표위
目的 预测和分析空肠弯曲菌(CJ)细胞扩张毒素(CDT) cdtA、cdtB、cdtC蛋白的二级结构和B细胞抗原表位,为CJ疫苗研制提供基础资料.方法 PCR扩增cdtA、cdtB、cdtC基因,克隆入pGEM-T载体并测序,对重组质粒测序后进行生物信息学分析.以cdtA、cdtB、cdtC基因推导的氨基酸序列为基础,采用Chou-Fasman法、Ganmier-Robson法和Karplus-Schulz法预测该蛋白二级结构;按Kyte-Doolittle方案、Emini方案和JamesonWolf方案预测其B细胞抗原表位.结果 克隆的cdtA、cdtB、cdtC基因全长分别为874bp、913bp、711bp.发现cdtA的840-32bp序列完全与标准株NCTC11168的1-807bp序列一致, cdtB的841-42bp序列完全与标准株NCTC11168的1-798bp序列一致,cdtC的667-96bp序列完全与标准株NCTC11168的1-570bp序列一致.cdtA第11～44和54～90区段, cdtB第5～70、78～112、137～187区段, cdtC第119～140和145～193区段及其附近可能是CJ-cdtA、cdtB、cdtC蛋白的B细胞表位优势区.结论 成功扩增空肠弯曲菌O∶19菌株cdtA、cdtB、cdtC基因,测序表明与标准株序列高度同源,已有文献证明cdtA、cdtB、cdtC基因在不同CJ菌株中高度保守,符合疫苗候选抗原的基本特征;预测出cdtA、cdtB、cdtC蛋白的B细胞抗原表位优势区,这将为CJ新型疫苗的设计和单克隆抗体的筛选等方面的研究提供重要信息.
目的 預測和分析空腸彎麯菌(CJ)細胞擴張毒素(CDT) cdtA、cdtB、cdtC蛋白的二級結構和B細胞抗原錶位,為CJ疫苗研製提供基礎資料.方法 PCR擴增cdtA、cdtB、cdtC基因,剋隆入pGEM-T載體併測序,對重組質粒測序後進行生物信息學分析.以cdtA、cdtB、cdtC基因推導的氨基痠序列為基礎,採用Chou-Fasman法、Ganmier-Robson法和Karplus-Schulz法預測該蛋白二級結構;按Kyte-Doolittle方案、Emini方案和JamesonWolf方案預測其B細胞抗原錶位.結果 剋隆的cdtA、cdtB、cdtC基因全長分彆為874bp、913bp、711bp.髮現cdtA的840-32bp序列完全與標準株NCTC11168的1-807bp序列一緻, cdtB的841-42bp序列完全與標準株NCTC11168的1-798bp序列一緻,cdtC的667-96bp序列完全與標準株NCTC11168的1-570bp序列一緻.cdtA第11～44和54～90區段, cdtB第5～70、78～112、137～187區段, cdtC第119～140和145～193區段及其附近可能是CJ-cdtA、cdtB、cdtC蛋白的B細胞錶位優勢區.結論 成功擴增空腸彎麯菌O∶19菌株cdtA、cdtB、cdtC基因,測序錶明與標準株序列高度同源,已有文獻證明cdtA、cdtB、cdtC基因在不同CJ菌株中高度保守,符閤疫苗候選抗原的基本特徵;預測齣cdtA、cdtB、cdtC蛋白的B細胞抗原錶位優勢區,這將為CJ新型疫苗的設計和單剋隆抗體的篩選等方麵的研究提供重要信息.
목적 예측화분석공장만곡균(CJ)세포확장독소(CDT) cdtA、cdtB、cdtC단백적이급결구화B세포항원표위,위CJ역묘연제제공기출자료.방법 PCR확증cdtA、cdtB、cdtC기인,극륭입pGEM-T재체병측서,대중조질립측서후진행생물신식학분석.이cdtA、cdtB、cdtC기인추도적안기산서렬위기출,채용Chou-Fasman법、Ganmier-Robson법화Karplus-Schulz법예측해단백이급결구;안Kyte-Doolittle방안、Emini방안화JamesonWolf방안예측기B세포항원표위.결과 극륭적cdtA、cdtB、cdtC기인전장분별위874bp、913bp、711bp.발현cdtA적840-32bp서렬완전여표준주NCTC11168적1-807bp서렬일치, cdtB적841-42bp서렬완전여표준주NCTC11168적1-798bp서렬일치,cdtC적667-96bp서렬완전여표준주NCTC11168적1-570bp서렬일치.cdtA제11～44화54～90구단, cdtB제5～70、78～112、137～187구단, cdtC제119～140화145～193구단급기부근가능시CJ-cdtA、cdtB、cdtC단백적B세포표위우세구.결론 성공확증공장만곡균O∶19균주cdtA、cdtB、cdtC기인,측서표명여표준주서렬고도동원,이유문헌증명cdtA、cdtB、cdtC기인재불동CJ균주중고도보수,부합역묘후선항원적기본특정;예측출cdtA、cdtB、cdtC단백적B세포항원표위우세구,저장위CJ신형역묘적설계화단극륭항체적사선등방면적연구제공중요신식.
