河南科技大学学报(自然科学版)
河南科技大學學報(自然科學版)
하남과기대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF HENAN UNIVERSITY OF SCIENCE & TECHNOLOGY(NATURAL SCIENCE)
2012年
3期
50-53,57
,共5页
马蓓蓓%龙塔%薛云%周峰%赵战勤
馬蓓蓓%龍塔%薛雲%週峰%趙戰勤
마배배%룡탑%설운%주봉%조전근
南阳黄牛%CD14%序列分析
南暘黃牛%CD14%序列分析
남양황우%CD14%서렬분석
根据GenBank发表的荷斯坦奶牛CD14基因的序列设计引物,通过PCR方法对南阳黄牛的CD14基因进行分段扩增并测序,拼接后得到包含CD14完整编码区以及5'端和3'端非编码区的2 969 bp的全序列.序列分析结果表明:南阳黄牛CD14基因开放阅读框全长966 bp,共编码321个氨基酸,碱基组成分别为A(18.4%)、T(18.4%)、C(32.9%)、G(30.2%),编码区与荷斯坦奶牛CD14基因相比发生了2个碱基突变,没有引起氨基酸的改变.在5'端和3'端存在较长的非编码区,与荷斯坦奶牛CD14基因相比发生了7个碱基突变.南阳黄牛的CD14基因与荷斯坦奶牛、水牛、绵羊、山羊、猪、猕猴、大猩猩、人、小鼠的同源性依次降低,分别为99.8%、98.2%、96.8%、92.8%、83.5%、79.8%、79.7%、79.5%、71.9%.进化树所得的聚类结果与传统的分类结果一致.通过蛋白质结构预测,发现南阳黄牛CD14没有跨膜结构域.
根據GenBank髮錶的荷斯坦奶牛CD14基因的序列設計引物,通過PCR方法對南暘黃牛的CD14基因進行分段擴增併測序,拼接後得到包含CD14完整編碼區以及5'耑和3'耑非編碼區的2 969 bp的全序列.序列分析結果錶明:南暘黃牛CD14基因開放閱讀框全長966 bp,共編碼321箇氨基痠,堿基組成分彆為A(18.4%)、T(18.4%)、C(32.9%)、G(30.2%),編碼區與荷斯坦奶牛CD14基因相比髮生瞭2箇堿基突變,沒有引起氨基痠的改變.在5'耑和3'耑存在較長的非編碼區,與荷斯坦奶牛CD14基因相比髮生瞭7箇堿基突變.南暘黃牛的CD14基因與荷斯坦奶牛、水牛、綿羊、山羊、豬、獼猴、大猩猩、人、小鼠的同源性依次降低,分彆為99.8%、98.2%、96.8%、92.8%、83.5%、79.8%、79.7%、79.5%、71.9%.進化樹所得的聚類結果與傳統的分類結果一緻.通過蛋白質結構預測,髮現南暘黃牛CD14沒有跨膜結構域.
근거GenBank발표적하사탄내우CD14기인적서렬설계인물,통과PCR방법대남양황우적CD14기인진행분단확증병측서,병접후득도포함CD14완정편마구이급5'단화3'단비편마구적2 969 bp적전서렬.서렬분석결과표명:남양황우CD14기인개방열독광전장966 bp,공편마321개안기산,감기조성분별위A(18.4%)、T(18.4%)、C(32.9%)、G(30.2%),편마구여하사탄내우CD14기인상비발생료2개감기돌변,몰유인기안기산적개변.재5'단화3'단존재교장적비편마구,여하사탄내우CD14기인상비발생료7개감기돌변.남양황우적CD14기인여하사탄내우、수우、면양、산양、저、미후、대성성、인、소서적동원성의차강저,분별위99.8%、98.2%、96.8%、92.8%、83.5%、79.8%、79.7%、79.5%、71.9%.진화수소득적취류결과여전통적분류결과일치.통과단백질결구예측,발현남양황우CD14몰유과막결구역.