质谱学报
質譜學報
질보학보
2008年
5期
268-273
,共6页
徐琨%朱尔一%杨芃原%刘银坤
徐琨%硃爾一%楊芃原%劉銀坤
서곤%주이일%양봉원%류은곤
肝细胞癌%表面加强激光解析电离-飞行时间质谱%偏最小二乘变量筛选%分类模型%海量数据建模
肝細胞癌%錶麵加彊激光解析電離-飛行時間質譜%偏最小二乘變量篩選%分類模型%海量數據建模
간세포암%표면가강격광해석전리-비행시간질보%편최소이승변량사선%분류모형%해량수거건모
通过对质谱数据处理和分析,建立肝细胞癌(HCC)病人与健康人的分类模型,可以用来判别样本是否来源于肝癌病人.运用表面加强激光解析电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)获取肝癌病人和健康人血清蛋白指纹图谱数据,并运用偏最小二乘(PLS)变量筛选法建立分类模型,最终得到分类模型的交叉检验相关系数达0.96以上,判别准确率大大提高.同时对模型进行分析,找出对肝癌病人和健康人的差异有重要影响的因素或变量.这些变量为30个质荷比区间内特定蛋白的峰强度值,反映这些质荷比区间内蛋白量的增加或减少与肝癌的形成有密切关系,可作为重要的生物标志物进一步加以研究.并且采用所得模型的拟合值等一些信息做分类图,能较好地表达回归模型的分类效果.
通過對質譜數據處理和分析,建立肝細胞癌(HCC)病人與健康人的分類模型,可以用來判彆樣本是否來源于肝癌病人.運用錶麵加彊激光解析電離-飛行時間質譜(SELDI-TOF-MS)穫取肝癌病人和健康人血清蛋白指紋圖譜數據,併運用偏最小二乘(PLS)變量篩選法建立分類模型,最終得到分類模型的交扠檢驗相關繫數達0.96以上,判彆準確率大大提高.同時對模型進行分析,找齣對肝癌病人和健康人的差異有重要影響的因素或變量.這些變量為30箇質荷比區間內特定蛋白的峰彊度值,反映這些質荷比區間內蛋白量的增加或減少與肝癌的形成有密切關繫,可作為重要的生物標誌物進一步加以研究.併且採用所得模型的擬閤值等一些信息做分類圖,能較好地錶達迴歸模型的分類效果.
통과대질보수거처리화분석,건립간세포암(HCC)병인여건강인적분류모형,가이용래판별양본시부래원우간암병인.운용표면가강격광해석전리-비행시간질보(SELDI-TOF-MS)획취간암병인화건강인혈청단백지문도보수거,병운용편최소이승(PLS)변량사선법건립분류모형,최종득도분류모형적교차검험상관계수체0.96이상,판별준학솔대대제고.동시대모형진행분석,조출대간암병인화건강인적차이유중요영향적인소혹변량.저사변량위30개질하비구간내특정단백적봉강도치,반영저사질하비구간내단백량적증가혹감소여간암적형성유밀절관계,가작위중요적생물표지물진일보가이연구.병차채용소득모형적의합치등일사신식주분류도,능교호지표체회귀모형적분류효과.