检验医学
檢驗醫學
검험의학
LABORATORY MEDICINE
2011年
8期
523-526
,共4页
汉坦病毒%HTN型%SEO型%M区基因%基因分型
漢坦病毒%HTN型%SEO型%M區基因%基因分型
한탄병독%HTN형%SEO형%M구기인%기인분형
目的 调查青岛地区肾综合征出血热病毒的流行情况,研究病毒在该地区的分子流行病学特征及基因分型.方法 采集64例肾综合征出血热(HFRS)急性期患者血清标本,提取血清中病毒RNA作为模板.根据GenBank中汉坦病毒基因序列,设计HTN型和SEO型的通用外套引物,同时分别设计HTN型特异性引物和SEO型的特异性引物作为内套引物.采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增汉坦病毒基因组M片段G1区基因序列并测序.测序结果利用DNA Star软件进行核苷酸序列分析.结果 在64例标本中用HTN型特异性引物扩增阳性6例,占9%;用SEO型特异性引物扩增阳性25例,占39%;总阳性率为48%.总体来看,青岛地区流行的汉坦病毒以SEO型为主.SEO型汉坦病毒间核苷酸序列的差异相对较小,在核苷酸序列水平其基因的离散度为0.3%～8.9%.HTN型汉坦病毒的变异率较高,其基因的离散度为2.6%～11.2%.结论 青岛地区汉坦病毒的流行以SEO型为主,HTN型并存,其中HTN型主要发生在胶南市.
目的 調查青島地區腎綜閤徵齣血熱病毒的流行情況,研究病毒在該地區的分子流行病學特徵及基因分型.方法 採集64例腎綜閤徵齣血熱(HFRS)急性期患者血清標本,提取血清中病毒RNA作為模闆.根據GenBank中漢坦病毒基因序列,設計HTN型和SEO型的通用外套引物,同時分彆設計HTN型特異性引物和SEO型的特異性引物作為內套引物.採用逆轉錄聚閤酶鏈反應(RT-PCR)擴增漢坦病毒基因組M片段G1區基因序列併測序.測序結果利用DNA Star軟件進行覈苷痠序列分析.結果 在64例標本中用HTN型特異性引物擴增暘性6例,佔9%;用SEO型特異性引物擴增暘性25例,佔39%;總暘性率為48%.總體來看,青島地區流行的漢坦病毒以SEO型為主.SEO型漢坦病毒間覈苷痠序列的差異相對較小,在覈苷痠序列水平其基因的離散度為0.3%～8.9%.HTN型漢坦病毒的變異率較高,其基因的離散度為2.6%～11.2%.結論 青島地區漢坦病毒的流行以SEO型為主,HTN型併存,其中HTN型主要髮生在膠南市.
목적 조사청도지구신종합정출혈열병독적류행정황,연구병독재해지구적분자류행병학특정급기인분형.방법 채집64례신종합정출혈열(HFRS)급성기환자혈청표본,제취혈청중병독RNA작위모판.근거GenBank중한탄병독기인서렬,설계HTN형화SEO형적통용외투인물,동시분별설계HTN형특이성인물화SEO형적특이성인물작위내투인물.채용역전록취합매련반응(RT-PCR)확증한탄병독기인조M편단G1구기인서렬병측서.측서결과이용DNA Star연건진행핵감산서렬분석.결과 재64례표본중용HTN형특이성인물확증양성6례,점9%;용SEO형특이성인물확증양성25례,점39%;총양성솔위48%.총체래간,청도지구류행적한탄병독이SEO형위주.SEO형한탄병독간핵감산서렬적차이상대교소,재핵감산서렬수평기기인적리산도위0.3%～8.9%.HTN형한탄병독적변이솔교고,기기인적리산도위2.6%～11.2%.결론 청도지구한탄병독적류행이SEO형위주,HTN형병존,기중HTN형주요발생재효남시.
