中国组织工程研究与临床康复
中國組織工程研究與臨床康複
중국조직공정연구여림상강복
JOURNAL OF CLINICAL REHABILITATIVE TISSUE ENGINEERING RESEARCH
2011年
33期
6090-6094
,共5页
张治国%牛旭艳%刘梅洁%李艳%吕爱平%鞠大宏
張治國%牛旭豔%劉梅潔%李豔%呂愛平%鞠大宏
장치국%우욱염%류매길%리염%려애평%국대굉
蛋白质相互作用网络%骨质疏松症%在线人类孟德尔遗传数据库%分子复合物%通路
蛋白質相互作用網絡%骨質疏鬆癥%在線人類孟德爾遺傳數據庫%分子複閤物%通路
단백질상호작용망락%골질소송증%재선인류맹덕이유전수거고%분자복합물%통로
背景:在蛋白质相互作用网络的基础上研究骨质疏松症,可以更深入全面了解其发生发展机制.目的:建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,对其中所含分子复合物涉及的生物学通路进行预测.方法:筛选在线人类孟德尔遗传数据库中的骨质疏松症遗传相关基因,应用Cytoscape 软件和插件Agilent Literature Search,进行文本挖掘并建立骨质疏松症的蛋白质相互作用网络;应用插件Clusterviz,发现网络中的可能包含的分子复合物;基于DAVID,富集分子复合物的生物学通路.结果与结论:人类孟德尔遗传数据库中骨质疏松遗传相关基因有177 个.骨质疏松症的蛋白质相互作用网络包含863 个节点(蛋白质)、2 925 条边(相互作用关系),可能包含4 个分子复合物.其中分子复合物3 涉及免疫细胞表面分子及其相互黏附、细胞因子与其受体的结合、造血和止血功能等生物学通路;分子复合物4 与糖尿病的发生有一定关系.
揹景:在蛋白質相互作用網絡的基礎上研究骨質疏鬆癥,可以更深入全麵瞭解其髮生髮展機製.目的:建立基于骨質疏鬆癥遺傳相關基因的蛋白質相互作用網絡,對其中所含分子複閤物涉及的生物學通路進行預測.方法:篩選在線人類孟德爾遺傳數據庫中的骨質疏鬆癥遺傳相關基因,應用Cytoscape 軟件和插件Agilent Literature Search,進行文本挖掘併建立骨質疏鬆癥的蛋白質相互作用網絡;應用插件Clusterviz,髮現網絡中的可能包含的分子複閤物;基于DAVID,富集分子複閤物的生物學通路.結果與結論:人類孟德爾遺傳數據庫中骨質疏鬆遺傳相關基因有177 箇.骨質疏鬆癥的蛋白質相互作用網絡包含863 箇節點(蛋白質)、2 925 條邊(相互作用關繫),可能包含4 箇分子複閤物.其中分子複閤物3 涉及免疫細胞錶麵分子及其相互黏附、細胞因子與其受體的結閤、造血和止血功能等生物學通路;分子複閤物4 與糖尿病的髮生有一定關繫.
배경:재단백질상호작용망락적기출상연구골질소송증,가이경심입전면료해기발생발전궤제.목적:건립기우골질소송증유전상관기인적단백질상호작용망락,대기중소함분자복합물섭급적생물학통로진행예측.방법:사선재선인류맹덕이유전수거고중적골질소송증유전상관기인,응용Cytoscape 연건화삽건Agilent Literature Search,진행문본알굴병건립골질소송증적단백질상호작용망락;응용삽건Clusterviz,발현망락중적가능포함적분자복합물;기우DAVID,부집분자복합물적생물학통로.결과여결론:인류맹덕이유전수거고중골질소송유전상관기인유177 개.골질소송증적단백질상호작용망락포함863 개절점(단백질)、2 925 조변(상호작용관계),가능포함4 개분자복합물.기중분자복합물3 섭급면역세포표면분자급기상호점부、세포인자여기수체적결합、조혈화지혈공능등생물학통로;분자복합물4 여당뇨병적발생유일정관계.
