海洋学报(中文版)
海洋學報(中文版)
해양학보(중문판)
ACTA OCEANOLOGICA SINICA
2012年
2期
136-142
,共7页
申欣%田美%朱长保%刘会莲%赵方庆
申訢%田美%硃長保%劉會蓮%趙方慶
신흔%전미%주장보%류회련%조방경
大室别藻苔虫%线粒体基因组%新一代测序技术%巢式PCR%基因排列
大室彆藻苔蟲%線粒體基因組%新一代測序技術%巢式PCR%基因排列
대실별조태충%선립체기인조%신일대측서기술%소식PCR%기인배렬
线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序.近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表.应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membranipora grandicella)的线粒体基因组全序列.大室别藻苔虫线粒体基因组是目前国际上获得的第一条苔藓动物软壁亚目线粒体基因组全序列,基因组全长为15 861 bp,比已完成的4种苔藓动物线粒体基因组略大.大室别藻苔虫线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和20个转运RNA基因.通过与已测得的苔藓动物进行比较,发现目前已完成的5个苔藓动物线粒体基因组的基因排列顺序显著不同.苔藓动物线粒体基因组基因排列的比较,今后可能会成为探讨该类群系统演化关系的重要信息来源.
線粒體基因組的穫得傳統上通常是採取長PCR結閤鳥鎗法或步移法測序.近年來新一代測序技術蓬勃髮展,以454,Solexa和SOLiD測序平檯為代錶.應用新一代高通量測序技術(Solexa)併結閤巢式PCR擴增,完成瞭大室彆藻苔蟲(Membranipora grandicella)的線粒體基因組全序列.大室彆藻苔蟲線粒體基因組是目前國際上穫得的第一條苔蘚動物軟壁亞目線粒體基因組全序列,基因組全長為15 861 bp,比已完成的4種苔蘚動物線粒體基因組略大.大室彆藻苔蟲線粒體基因組包含13箇蛋白質編碼基因、2箇覈糖體RNA基因和20箇轉運RNA基因.通過與已測得的苔蘚動物進行比較,髮現目前已完成的5箇苔蘚動物線粒體基因組的基因排列順序顯著不同.苔蘚動物線粒體基因組基因排列的比較,今後可能會成為探討該類群繫統縯化關繫的重要信息來源.
선립체기인조적획득전통상통상시채취장PCR결합조창법혹보이법측서.근년래신일대측서기술봉발발전,이454,Solexa화SOLiD측서평태위대표.응용신일대고통량측서기술(Solexa)병결합소식PCR확증,완성료대실별조태충(Membranipora grandicella)적선립체기인조전서렬.대실별조태충선립체기인조시목전국제상획득적제일조태선동물연벽아목선립체기인조전서렬,기인조전장위15 861 bp,비이완성적4충태선동물선립체기인조략대.대실별조태충선립체기인조포함13개단백질편마기인、2개핵당체RNA기인화20개전운RNA기인.통과여이측득적태선동물진행비교,발현목전이완성적5개태선동물선립체기인조적기인배렬순서현저불동.태선동물선립체기인조기인배렬적비교,금후가능회성위탐토해류군계통연화관계적중요신식래원.