解放军医学杂志
解放軍醫學雜誌
해방군의학잡지
MEDICAL JOURNAL OF CHINESE PEOPLE'S LIBERATION ARMY
2007年
5期
496-499
,共4页
三氧化二砷%NB4细胞%细胞凋亡%基因芯片
三氧化二砷%NB4細胞%細胞凋亡%基因芯片
삼양화이신%NB4세포%세포조망%기인심편
目的 利用基因芯片技术研究NB4细胞经三氧化二砷(As2O3)诱导凋亡后的凋亡相关基因表达变化.方法 检索NCBI的Entrez以及Human IPI数据库,通过染色体定位来排除冗余基因,共获得1 384个凋亡相关基因.探针使用软件OligoArray 2.0设计,并作Blast比对.设计基因特异寡核苷酸探针,合成后点样,制备寡核苷酸芯片.用2μmol/L的As2O3处理NB4细胞48h后,提取细胞总RNA,分别以Cy3,Cy5标记对照组及实验组,随后与含1 384个凋亡相关基因的寡核苷酸芯片杂交,使用基因芯片扫描仪对杂交信号扫描,软件分析Cy3和Cy5两种荧光信号的强度和比值,找出经As2O3处理后出现差异表达的基因,并挑选其中差异表达最明显的4条基因,设计引物后与CNDA产物进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳进行验证.结果 NB4细胞经2μmol/L As2O3作用48h后共有4个基因表达上调,12个基因表达下调,且RT-PCR验证结果与基因芯片结果完全相符.结论 As2O3可以诱导NB4细胞一系列基因表达的改变,这些涉及信号转导、转录调节、细胞周期、氧化应激、蛋白质的翻译合成及细胞分化等方面基因的差异表达,可能在NB4细胞凋亡中起着重要作用.
目的 利用基因芯片技術研究NB4細胞經三氧化二砷(As2O3)誘導凋亡後的凋亡相關基因錶達變化.方法 檢索NCBI的Entrez以及Human IPI數據庫,通過染色體定位來排除冗餘基因,共穫得1 384箇凋亡相關基因.探針使用軟件OligoArray 2.0設計,併作Blast比對.設計基因特異寡覈苷痠探針,閤成後點樣,製備寡覈苷痠芯片.用2μmol/L的As2O3處理NB4細胞48h後,提取細胞總RNA,分彆以Cy3,Cy5標記對照組及實驗組,隨後與含1 384箇凋亡相關基因的寡覈苷痠芯片雜交,使用基因芯片掃描儀對雜交信號掃描,軟件分析Cy3和Cy5兩種熒光信號的彊度和比值,找齣經As2O3處理後齣現差異錶達的基因,併挑選其中差異錶達最明顯的4條基因,設計引物後與CNDA產物進行PCR擴增,瓊脂糖凝膠電泳進行驗證.結果 NB4細胞經2μmol/L As2O3作用48h後共有4箇基因錶達上調,12箇基因錶達下調,且RT-PCR驗證結果與基因芯片結果完全相符.結論 As2O3可以誘導NB4細胞一繫列基因錶達的改變,這些涉及信號轉導、轉錄調節、細胞週期、氧化應激、蛋白質的翻譯閤成及細胞分化等方麵基因的差異錶達,可能在NB4細胞凋亡中起著重要作用.
목적 이용기인심편기술연구NB4세포경삼양화이신(As2O3)유도조망후적조망상관기인표체변화.방법 검색NCBI적Entrez이급Human IPI수거고,통과염색체정위래배제용여기인,공획득1 384개조망상관기인.탐침사용연건OligoArray 2.0설계,병작Blast비대.설계기인특이과핵감산탐침,합성후점양,제비과핵감산심편.용2μmol/L적As2O3처리NB4세포48h후,제취세포총RNA,분별이Cy3,Cy5표기대조조급실험조,수후여함1 384개조망상관기인적과핵감산심편잡교,사용기인심편소묘의대잡교신호소묘,연건분석Cy3화Cy5량충형광신호적강도화비치,조출경As2O3처리후출현차이표체적기인,병도선기중차이표체최명현적4조기인,설계인물후여CNDA산물진행PCR확증,경지당응효전영진행험증.결과 NB4세포경2μmol/L As2O3작용48h후공유4개기인표체상조,12개기인표체하조,차RT-PCR험증결과여기인심편결과완전상부.결론 As2O3가이유도NB4세포일계렬기인표체적개변,저사섭급신호전도、전록조절、세포주기、양화응격、단백질적번역합성급세포분화등방면기인적차이표체,가능재NB4세포조망중기착중요작용.
