林业科学研究
林業科學研究
임업과학연구
FOREST RESEARCH
2012年
4期
411-418
,共8页
张俊红%吴涛%韩素英%齐力旺%张守攻
張俊紅%吳濤%韓素英%齊力旺%張守攻
장준홍%오도%한소영%제력왕%장수공
日本落叶松%体细胞胚胎%microRNA%针叶树%表达分析
日本落葉鬆%體細胞胚胎%microRNA%針葉樹%錶達分析
일본락협송%체세포배태%microRNA%침협수%표체분석
以落叶松体细胞胚胎发育8个阶段的材料构建小RNA文库,进行了Solexa测序、miRNA鉴定、靶基因预测、qRT-PCR定量分析等研究.结果表明:发现的87个miRNAs中,29个为针叶树特异的,来自12个家族,分别为miR946、miP947、miR950、miR951、miR1311、miR1312、miR1313、miR1314、miR1316、miR3701、miR3702和miR3704,其中25个长度为22nt,且在小RNA文库中的最低拷贝数为18(miR1311),最高拷贝数为33 009(miR950).发现12个miRNA家族的34个靶基因可能参与生长发育、抗病、AGO反馈调节等多方面遗传调控；qRT-PCR分析表明:72％miRNAs表达次高峰在后期单胚或早期子叶胚,在中期子叶胚最低,最高峰在后期子叶胚,分别与子叶形成、胚胎后熟、胚胎休眠的生理活动相吻合,而miRNA前体的表达模式不同于miRNA,前体变化幅度小于成熟体.
以落葉鬆體細胞胚胎髮育8箇階段的材料構建小RNA文庫,進行瞭Solexa測序、miRNA鑒定、靶基因預測、qRT-PCR定量分析等研究.結果錶明:髮現的87箇miRNAs中,29箇為針葉樹特異的,來自12箇傢族,分彆為miR946、miP947、miR950、miR951、miR1311、miR1312、miR1313、miR1314、miR1316、miR3701、miR3702和miR3704,其中25箇長度為22nt,且在小RNA文庫中的最低拷貝數為18(miR1311),最高拷貝數為33 009(miR950).髮現12箇miRNA傢族的34箇靶基因可能參與生長髮育、抗病、AGO反饋調節等多方麵遺傳調控；qRT-PCR分析錶明:72％miRNAs錶達次高峰在後期單胚或早期子葉胚,在中期子葉胚最低,最高峰在後期子葉胚,分彆與子葉形成、胚胎後熟、胚胎休眠的生理活動相吻閤,而miRNA前體的錶達模式不同于miRNA,前體變化幅度小于成熟體.
이락협송체세포배태발육8개계단적재료구건소RNA문고,진행료Solexa측서、miRNA감정、파기인예측、qRT-PCR정량분석등연구.결과표명:발현적87개miRNAs중,29개위침협수특이적,래자12개가족,분별위miR946、miP947、miR950、miR951、miR1311、miR1312、miR1313、miR1314、miR1316、miR3701、miR3702화miR3704,기중25개장도위22nt,차재소RNA문고중적최저고패수위18(miR1311),최고고패수위33 009(miR950).발현12개miRNA가족적34개파기인가능삼여생장발육、항병、AGO반궤조절등다방면유전조공；qRT-PCR분석표명:72％miRNAs표체차고봉재후기단배혹조기자협배,재중기자협배최저,최고봉재후기자협배,분별여자협형성、배태후숙、배태휴면적생리활동상문합,이miRNA전체적표체모식불동우miRNA,전체변화폭도소우성숙체.
