环境科学
環境科學
배경과학
CHINESE JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCE
2008年
4期
1082-1091
,共10页
刘敏%朱开玲%李洪波%张涛%肖天
劉敏%硃開玲%李洪波%張濤%肖天
류민%주개령%리홍파%장도%초천
细菌群落组成%16S rDNA序列分析%PCR-DGGE%黄海冷水团
細菌群落組成%16S rDNA序列分析%PCR-DGGE%黃海冷水糰
세균군락조성%16S rDNA서렬분석%PCR-DGGE%황해랭수단
利用PCR-DGGE技术对2个季节(2006-04和2006-10)的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近(约17条),多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条,其多样性也较丰富;而在冷水团范围以外站位的条带少(约12条),其多样性较低.细菌16S rDNAV3区特征片段经DGGE分离、条带切割,共得到24条条带,克隆、测序后,进行系统进化分析,结果显示这24条带分别归属于2个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroides).在24条序列中有16条分别与变形细菌亚群的γ和δ-Proteobacteria相似,有5条与拟杆菌门相似.时空分析发现,4月份所有站位水体(海水温度为7-12℃)的细菌群落组成和10月份(冷水团存在期)冷水团内部水体(海水温度低于10℃)的细菌群落组成相同(都包括γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria和Bacteroides),与10月份冷水团外部水体(海水温度大于19℃)的(包括γ-Proteobacteria和Bacteroides)不同.优势菌群也存在同样的分布特点,4月份所有站位水体的优势菌群与10月份冷水团内部水体的优势菌群也相同(都是γ-Proteobacteria),而10月份冷水团外部水体不同的站位优势菌群不同.该海域细菌群落组成和优势菌群的分布特点,可能与冷水团的形成有一定的相关性.
利用PCR-DGGE技術對2箇季節(2006-04和2006-10)的黃海冷水糰海域的細菌群落組成和優勢菌群進行瞭分析.通過軟件Glyko Bandscan分析DGGE圖譜,4月份所有站位的條帶數相近(約17條),多樣性豐富;10月份,在冷水糰範圍以內站位的條帶約16條,其多樣性也較豐富;而在冷水糰範圍以外站位的條帶少(約12條),其多樣性較低.細菌16S rDNAV3區特徵片段經DGGE分離、條帶切割,共得到24條條帶,剋隆、測序後,進行繫統進化分析,結果顯示這24條帶分彆歸屬于2箇細菌類群:變形細菌門(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteroides).在24條序列中有16條分彆與變形細菌亞群的γ和δ-Proteobacteria相似,有5條與擬桿菌門相似.時空分析髮現,4月份所有站位水體(海水溫度為7-12℃)的細菌群落組成和10月份(冷水糰存在期)冷水糰內部水體(海水溫度低于10℃)的細菌群落組成相同(都包括γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria和Bacteroides),與10月份冷水糰外部水體(海水溫度大于19℃)的(包括γ-Proteobacteria和Bacteroides)不同.優勢菌群也存在同樣的分佈特點,4月份所有站位水體的優勢菌群與10月份冷水糰內部水體的優勢菌群也相同(都是γ-Proteobacteria),而10月份冷水糰外部水體不同的站位優勢菌群不同.該海域細菌群落組成和優勢菌群的分佈特點,可能與冷水糰的形成有一定的相關性.
이용PCR-DGGE기술대2개계절(2006-04화2006-10)적황해랭수단해역적세균군락조성화우세균군진행료분석.통과연건Glyko Bandscan분석DGGE도보,4월빈소유참위적조대수상근(약17조),다양성봉부;10월빈,재랭수단범위이내참위적조대약16조,기다양성야교봉부;이재랭수단범위이외참위적조대소(약12조),기다양성교저.세균16S rDNAV3구특정편단경DGGE분리、조대절할,공득도24조조대,극륭、측서후,진행계통진화분석,결과현시저24조대분별귀속우2개세균류군:변형세균문(Proteobacteria)화의간균문(Bacteroides).재24조서렬중유16조분별여변형세균아군적γ화δ-Proteobacteria상사,유5조여의간균문상사.시공분석발현,4월빈소유참위수체(해수온도위7-12℃)적세균군락조성화10월빈(랭수단존재기)랭수단내부수체(해수온도저우10℃)적세균군락조성상동(도포괄γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria화Bacteroides),여10월빈랭수단외부수체(해수온도대우19℃)적(포괄γ-Proteobacteria화Bacteroides)불동.우세균군야존재동양적분포특점,4월빈소유참위수체적우세균군여10월빈랭수단내부수체적우세균군야상동(도시γ-Proteobacteria),이10월빈랭수단외부수체불동적참위우세균군불동.해해역세균군락조성화우세균군적분포특점,가능여랭수단적형성유일정적상관성.