生态科学
生態科學
생태과학
ECOLOGIC SCIENCE
2008年
1期
24-30
,共7页
袁嘉恩%许忠能%韩博平%孔义军%雷腊梅%谢数涛
袁嘉恩%許忠能%韓博平%孔義軍%雷臘梅%謝數濤
원가은%허충능%한박평%공의군%뢰석매%사수도
Hsp70基因%RACE%RT-PCR%锯缘青蟹
Hsp70基因%RACE%RT-PCR%鋸緣青蟹
Hsp70기인%RACE%RT-PCR%거연청해
采用RT-PCR及RACE技术克隆锯缘青蟹(Scylla serrata)的热休克蛋白Hsp70基因并进行序列分析.克隆测序后拼接得到一条长2482bp的cDNA序列,该序列ORF (Open reading frame,开放阅读框)为1950bp,编码649个氨基酸,分子量约为71.06kD,理论等电点为5.24.3'UTR (untranslated region,非编码区)为158bp,5'UTR为40bp.通过antheprot分析发现2个Hsp70家族的签名序列:IFDLGGGTFDVSIL, IVLVGGSTRIPKIQK; Dnak特征基序DLGTT-S-V;非细胞器基序:RARFEEL;核定位信号标签:KKDPSESKRALRRL;胞质Hsp70特征基序EEVD.同源性分析表明,锯缘青蟹Hsp70编码区核苷酸序列与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、斑节对虾(Penaeus monodon)、罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)的相似性分别为84.02%、83.87%和79.60%;核苷酸序列所推导出的Hsp70氨基酸序列,与凡纳滨对虾、斑节对虾和罗氏沼虾的相似性分别为92.79%、92.17%和96.47%.本研究克隆了锯缘青蟹Hsp70基因,为进一步深入研究锯缘青蟹的抗逆机理及其遗传改良奠定了基础.
採用RT-PCR及RACE技術剋隆鋸緣青蟹(Scylla serrata)的熱休剋蛋白Hsp70基因併進行序列分析.剋隆測序後拼接得到一條長2482bp的cDNA序列,該序列ORF (Open reading frame,開放閱讀框)為1950bp,編碼649箇氨基痠,分子量約為71.06kD,理論等電點為5.24.3'UTR (untranslated region,非編碼區)為158bp,5'UTR為40bp.通過antheprot分析髮現2箇Hsp70傢族的籤名序列:IFDLGGGTFDVSIL, IVLVGGSTRIPKIQK; Dnak特徵基序DLGTT-S-V;非細胞器基序:RARFEEL;覈定位信號標籤:KKDPSESKRALRRL;胞質Hsp70特徵基序EEVD.同源性分析錶明,鋸緣青蟹Hsp70編碼區覈苷痠序列與凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)、斑節對蝦(Penaeus monodon)、囉氏沼蝦(Macrobrachium rosenbergii)的相似性分彆為84.02%、83.87%和79.60%;覈苷痠序列所推導齣的Hsp70氨基痠序列,與凡納濱對蝦、斑節對蝦和囉氏沼蝦的相似性分彆為92.79%、92.17%和96.47%.本研究剋隆瞭鋸緣青蟹Hsp70基因,為進一步深入研究鋸緣青蟹的抗逆機理及其遺傳改良奠定瞭基礎.
채용RT-PCR급RACE기술극륭거연청해(Scylla serrata)적열휴극단백Hsp70기인병진행서렬분석.극륭측서후병접득도일조장2482bp적cDNA서렬,해서렬ORF (Open reading frame,개방열독광)위1950bp,편마649개안기산,분자량약위71.06kD,이론등전점위5.24.3'UTR (untranslated region,비편마구)위158bp,5'UTR위40bp.통과antheprot분석발현2개Hsp70가족적첨명서렬:IFDLGGGTFDVSIL, IVLVGGSTRIPKIQK; Dnak특정기서DLGTT-S-V;비세포기기서:RARFEEL;핵정위신호표첨:KKDPSESKRALRRL;포질Hsp70특정기서EEVD.동원성분석표명,거연청해Hsp70편마구핵감산서렬여범납빈대하(Litopenaeus vannamei)、반절대하(Penaeus monodon)、라씨소하(Macrobrachium rosenbergii)적상사성분별위84.02%、83.87%화79.60%;핵감산서렬소추도출적Hsp70안기산서렬,여범납빈대하、반절대하화라씨소하적상사성분별위92.79%、92.17%화96.47%.본연구극륭료거연청해Hsp70기인,위진일보심입연구거연청해적항역궤리급기유전개량전정료기출.
