西北农业学报
西北農業學報
서북농업학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-OCCIDENTALIS SINICA
2009年
1期
165-169
,共5页
陈旭玉%周亚奎%余贤美%林春花%郑服丛
陳旭玉%週亞奎%餘賢美%林春花%鄭服叢
진욱옥%주아규%여현미%림춘화%정복총
宏基因组文库%拈抗%稻瘟菌%筛选
宏基因組文庫%拈抗%稻瘟菌%篩選
굉기인조문고%념항%도온균%사선
从橡胶林土壤中提取微生物总DNA,用Pst Ⅰ酶切后,酶切液与pBluescriptKS+载体连接转入大肠杆菌,构建了包含7 680个克隆子的宏基因组文库,76.2%的质粒含有外源DNA,插入片段的平均大小为4.3kb,DNA文库的容量为32.25MB.首先用序列筛选方法对土壤宏基因组文库进行筛选,共得到11个克隆子,通过对11个克隆子进行功能筛选(复筛),发现克隆子JKDL-1和JKDL-2对稻瘟菌有明显抑制作用,其余的9个克隆子对稻瘟菌没有明显活性.具有拮抗作用的克隆子通过NCBI的Blastx分析,发现JKDL-1和JKDL-2分别与柄杆菌属(Caulobacter sp. K31)和布克氏菌属(Burkholderia ambifaria MC40-6)有75%和77%的同源性,初步预测其功能为组氨酸激酶(GAF sensor hybrid histidine kinase)和乙酰辅酶A乙酰转移酶(acetyl-CoA acetyltransferases).
從橡膠林土壤中提取微生物總DNA,用Pst Ⅰ酶切後,酶切液與pBluescriptKS+載體連接轉入大腸桿菌,構建瞭包含7 680箇剋隆子的宏基因組文庫,76.2%的質粒含有外源DNA,插入片段的平均大小為4.3kb,DNA文庫的容量為32.25MB.首先用序列篩選方法對土壤宏基因組文庫進行篩選,共得到11箇剋隆子,通過對11箇剋隆子進行功能篩選(複篩),髮現剋隆子JKDL-1和JKDL-2對稻瘟菌有明顯抑製作用,其餘的9箇剋隆子對稻瘟菌沒有明顯活性.具有拮抗作用的剋隆子通過NCBI的Blastx分析,髮現JKDL-1和JKDL-2分彆與柄桿菌屬(Caulobacter sp. K31)和佈剋氏菌屬(Burkholderia ambifaria MC40-6)有75%和77%的同源性,初步預測其功能為組氨痠激酶(GAF sensor hybrid histidine kinase)和乙酰輔酶A乙酰轉移酶(acetyl-CoA acetyltransferases).
종상효림토양중제취미생물총DNA,용Pst Ⅰ매절후,매절액여pBluescriptKS+재체련접전입대장간균,구건료포함7 680개극륭자적굉기인조문고,76.2%적질립함유외원DNA,삽입편단적평균대소위4.3kb,DNA문고적용량위32.25MB.수선용서렬사선방법대토양굉기인조문고진행사선,공득도11개극륭자,통과대11개극륭자진행공능사선(복사),발현극륭자JKDL-1화JKDL-2대도온균유명현억제작용,기여적9개극륭자대도온균몰유명현활성.구유길항작용적극륭자통과NCBI적Blastx분석,발현JKDL-1화JKDL-2분별여병간균속(Caulobacter sp. K31)화포극씨균속(Burkholderia ambifaria MC40-6)유75%화77%적동원성,초보예측기공능위조안산격매(GAF sensor hybrid histidine kinase)화을선보매A을선전이매(acetyl-CoA acetyltransferases).
