安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2008年
9期
3531-3534
,共4页
骈瑞琪%李伟%李娜%陈晓阳%倪慧群
駢瑞琪%李偉%李娜%陳曉暘%倪慧群
병서기%리위%리나%진효양%예혜군
蒺藜苜蓿%叶绿体微卫星%分布规律
蒺藜苜蓿%葉綠體微衛星%分佈規律
질려목숙%협록체미위성%분포규률
利用已公布的蒺藜苜蓿(Medicao truntula)叶绿体DNA(cpDNA)序列测序结果,应用生物信息学软件对蒺藜苜蓿微卫星位点的分布情况进行了统计分析,结果表明:在已公布的124 033 bp的蒺藜苜蓿叶绿体基因组序列中,共有341个SSR序列,SSR的碱基总数达3 987 bp,约占整个基因组的3.2%;在所有SSR序列中,数量最多的是单碱基SSR,数量达到297个,占总数的87.1%.其次是二碱基重复序列,占12.6%,三碱基微卫星序列最少,仅有1个,大于三碱基的微卫星数为0;在单碱基重复中又以A和T重复为主,占单碱基重复总数的84.5%,二碱基重复也以AT和TA为主,占95.5%,单碱基中的纯粹重复类型占总数的65.3%.研究结果为该物种的分子标记的筛选提供了基础信息.
利用已公佈的蒺藜苜蓿(Medicao truntula)葉綠體DNA(cpDNA)序列測序結果,應用生物信息學軟件對蒺藜苜蓿微衛星位點的分佈情況進行瞭統計分析,結果錶明:在已公佈的124 033 bp的蒺藜苜蓿葉綠體基因組序列中,共有341箇SSR序列,SSR的堿基總數達3 987 bp,約佔整箇基因組的3.2%;在所有SSR序列中,數量最多的是單堿基SSR,數量達到297箇,佔總數的87.1%.其次是二堿基重複序列,佔12.6%,三堿基微衛星序列最少,僅有1箇,大于三堿基的微衛星數為0;在單堿基重複中又以A和T重複為主,佔單堿基重複總數的84.5%,二堿基重複也以AT和TA為主,佔95.5%,單堿基中的純粹重複類型佔總數的65.3%.研究結果為該物種的分子標記的篩選提供瞭基礎信息.
이용이공포적질려목숙(Medicao truntula)협록체DNA(cpDNA)서렬측서결과,응용생물신식학연건대질려목숙미위성위점적분포정황진행료통계분석,결과표명:재이공포적124 033 bp적질려목숙협록체기인조서렬중,공유341개SSR서렬,SSR적감기총수체3 987 bp,약점정개기인조적3.2%;재소유SSR서렬중,수량최다적시단감기SSR,수량체도297개,점총수적87.1%.기차시이감기중복서렬,점12.6%,삼감기미위성서렬최소,부유1개,대우삼감기적미위성수위0;재단감기중복중우이A화T중복위주,점단감기중복총수적84.5%,이감기중복야이AT화TA위주,점95.5%,단감기중적순수중복류형점총수적65.3%.연구결과위해물충적분자표기적사선제공료기출신식.
