蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2011年
5期
818-824
,共7页
陈蔚%黄勇%赵巧玲%宋菲%裘智勇%夏定国%沈兴家
陳蔚%黃勇%趙巧玲%宋菲%裘智勇%夏定國%瀋興傢
진위%황용%조교령%송비%구지용%하정국%침흥가
家蚕核型多角体病毒%小RNA%生物信息学%反转录PCR%靶基因
傢蠶覈型多角體病毒%小RNA%生物信息學%反轉錄PCR%靶基因
가잠핵형다각체병독%소RNA%생물신식학%반전록PCR%파기인
microRNAs (miRNAs)是长度为18～25 nt的非蛋白质编码小RNA分子,可以通过抑制有关基因mRNA的翻译从而调控机体的生长发育、疾病发生等过程.在很多病毒中发现有miRNA的存在,这些miRNA可能在病毒基因的表达以及与宿主的相互作用中发挥作用.利用vMir软件预测家蚕核型多角体病毒(BmNPV)基因组可能编码的miRNA前体序列,对BmNPV基因组扫描分析后,得到7条能形成发夹结构的可能是miRNA的候选前体序列.以BmNPV添食感染5龄起蚕,72 h后取幼虫血淋巴提取总RNA,对这7条序列进行反转录PCR验证,其中扩增出的5条序列在BmNPV基因组中有相同的序列,推测这5条序列为BmNPV基因组编码的miRNA前体序列.进一步分析5条miRNA前体序列的发夹结构,并用反转录PCR的方法验证其成熟体序列,结果在5条miRNA前体序列共扩增出6条在BmNPV基因组中有相同序列的成熟体序列,它们分别位于不同的ORF之间,是BmNPV基因组编码的miRNA.利用在线靶基因预测程序RNAhybrid和RNA22预测到6条miRNA在BmNPV中的13个可能的靶基因,其中有6个靶基因是病毒的结构蛋白基因,2个为晚期表达因子基因,5个为未知功能基因.推测这些BmNPV基因组编码的miRNA可能与病毒感染宿主有关.
microRNAs (miRNAs)是長度為18～25 nt的非蛋白質編碼小RNA分子,可以通過抑製有關基因mRNA的翻譯從而調控機體的生長髮育、疾病髮生等過程.在很多病毒中髮現有miRNA的存在,這些miRNA可能在病毒基因的錶達以及與宿主的相互作用中髮揮作用.利用vMir軟件預測傢蠶覈型多角體病毒(BmNPV)基因組可能編碼的miRNA前體序列,對BmNPV基因組掃描分析後,得到7條能形成髮夾結構的可能是miRNA的候選前體序列.以BmNPV添食感染5齡起蠶,72 h後取幼蟲血淋巴提取總RNA,對這7條序列進行反轉錄PCR驗證,其中擴增齣的5條序列在BmNPV基因組中有相同的序列,推測這5條序列為BmNPV基因組編碼的miRNA前體序列.進一步分析5條miRNA前體序列的髮夾結構,併用反轉錄PCR的方法驗證其成熟體序列,結果在5條miRNA前體序列共擴增齣6條在BmNPV基因組中有相同序列的成熟體序列,它們分彆位于不同的ORF之間,是BmNPV基因組編碼的miRNA.利用在線靶基因預測程序RNAhybrid和RNA22預測到6條miRNA在BmNPV中的13箇可能的靶基因,其中有6箇靶基因是病毒的結構蛋白基因,2箇為晚期錶達因子基因,5箇為未知功能基因.推測這些BmNPV基因組編碼的miRNA可能與病毒感染宿主有關.
microRNAs (miRNAs)시장도위18～25 nt적비단백질편마소RNA분자,가이통과억제유관기인mRNA적번역종이조공궤체적생장발육、질병발생등과정.재흔다병독중발현유miRNA적존재,저사miRNA가능재병독기인적표체이급여숙주적상호작용중발휘작용.이용vMir연건예측가잠핵형다각체병독(BmNPV)기인조가능편마적miRNA전체서렬,대BmNPV기인조소묘분석후,득도7조능형성발협결구적가능시miRNA적후선전체서렬.이BmNPV첨식감염5령기잠,72 h후취유충혈림파제취총RNA,대저7조서렬진행반전록PCR험증,기중확증출적5조서렬재BmNPV기인조중유상동적서렬,추측저5조서렬위BmNPV기인조편마적miRNA전체서렬.진일보분석5조miRNA전체서렬적발협결구,병용반전록PCR적방법험증기성숙체서렬,결과재5조miRNA전체서렬공확증출6조재BmNPV기인조중유상동서렬적성숙체서렬,타문분별위우불동적ORF지간,시BmNPV기인조편마적miRNA.이용재선파기인예측정서RNAhybrid화RNA22예측도6조miRNA재BmNPV중적13개가능적파기인,기중유6개파기인시병독적결구단백기인,2개위만기표체인자기인,5개위미지공능기인.추측저사BmNPV기인조편마적miRNA가능여병독감염숙주유관.
