CAJ | 학술논문

目的研究甲型流感病毒基因变异与生存选择压力的关系,指导保守疫苗靶位点的寻找.方法选择相同血凝素(HA)血清型具有全基因组序列的分化距离较近的多个流感病毒株系,利用Blast2程序计算各株系之间的核酸保守性、蛋白质保守性、变异核苷酸在密码子序位中的频率以及生存选择压力指数,分析与生存选择压力指数的相关性.结果HA基因较其他基因的核酸保守性为显著低;HA抗原蛋白质保守性与NS基因同为较低;HA基因受生存选择压力作用;NS、聚合酶B1(PB1)基因受选择压力较小;NA、核蛋白(NP)基因受选择压力较大;生存选择压力指数与核苷酸第3密码子位点变异频率完全相关.结论流感病毒基因变异受复制机制形成差异和生存选择压力淘汰差异双重作用影响;各基因在流感病毒生物功能中地位不同,NA、NP基因保守性较强,适宜作为疫苗靶位点候选,HA基因相比较具有一定的保守性,有望寻找到保守区段,NS、PB1基因保守性较弱,不宜作为靶位点.
목적연구갑형류감병독기인변이여생존선택압력적관계,지도보수역묘파위점적심조.방법선택상동혈응소(HA)혈청형구유전기인조서렬적분화거리교근적다개류감병독주계,이용Blast2정서계산각주계지간적핵산보수성、단백질보수성、변이핵감산재밀마자서위중적빈솔이급생존선택압력지수,분석여생존선택압력지수적상관성.결과HA기인교기타기인적핵산보수성위현저저;HA항원단백질보수성여NS기인동위교저;HA기인수생존선택압력작용;NS、취합매B1(PB1)기인수선택압력교소;NA、핵단백(NP)기인수선택압력교대;생존선택압력지수여핵감산제3밀마자위점변이빈솔완전상관.결론류감병독기인변이수복제궤제형성차이화생존선택압력도태차이쌍중작용영향;각기인재류감병독생물공능중지위불동,NA、NP기인보수성교강,괄의작위역묘파위점후선,HA기인상비교구유일정적보수성,유망심조도보수구단,NS、PB1기인보수성교약,불의작위파위점.