遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2009年
6期
638-644
,共7页
鄂洋%林凤%张春宇%崔娜%许玉凤
鄂洋%林鳳%張春宇%崔娜%許玉鳳
악양%림봉%장춘우%최나%허옥봉
玉米大斑病%候选序列%抗性基因
玉米大斑病%候選序列%抗性基因
옥미대반병%후선서렬%항성기인
为获得玉米大斑病抗性基因Ht1候选序列,文章采用生物信息学方法对与玉米大斑病抗性基因Ht1紧密连锁的分子标记umc22和umc122定位区域内候选序列进行了分析,其中得到的63条ORF序列中有14条序列可编码蛋白质结构域.将14条核苷酸酸序列预测出的氨基酸序列与已克隆的24条抗性基因编码氨基酸序列进行Blast比对及进化树构建.结果发现,候选序列gpm565a具有植物抗性基因编码产物的高度保守结构域,而且与抗性基因Xal相似性高、亲缘关系近,推测可能与抗性基因Ht1有关.其他候选序列由于不具有植物抗性基因编码产物的高度保守结构域或者相似性低,亲缘关系远等原因,不能确定与抗性基因Ht1有关.通过对候选序列gpm565a进行二级结构及三维结构分析,发现有大量构成蛋白质特异功能结构组件的无规则卷曲存在,推测gpm565a可能是Ht1功能域的一部分.
為穫得玉米大斑病抗性基因Ht1候選序列,文章採用生物信息學方法對與玉米大斑病抗性基因Ht1緊密連鎖的分子標記umc22和umc122定位區域內候選序列進行瞭分析,其中得到的63條ORF序列中有14條序列可編碼蛋白質結構域.將14條覈苷痠痠序列預測齣的氨基痠序列與已剋隆的24條抗性基因編碼氨基痠序列進行Blast比對及進化樹構建.結果髮現,候選序列gpm565a具有植物抗性基因編碼產物的高度保守結構域,而且與抗性基因Xal相似性高、親緣關繫近,推測可能與抗性基因Ht1有關.其他候選序列由于不具有植物抗性基因編碼產物的高度保守結構域或者相似性低,親緣關繫遠等原因,不能確定與抗性基因Ht1有關.通過對候選序列gpm565a進行二級結構及三維結構分析,髮現有大量構成蛋白質特異功能結構組件的無規則捲麯存在,推測gpm565a可能是Ht1功能域的一部分.
위획득옥미대반병항성기인Ht1후선서렬,문장채용생물신식학방법대여옥미대반병항성기인Ht1긴밀련쇄적분자표기umc22화umc122정위구역내후선서렬진행료분석,기중득도적63조ORF서렬중유14조서렬가편마단백질결구역.장14조핵감산산서렬예측출적안기산서렬여이극륭적24조항성기인편마안기산서렬진행Blast비대급진화수구건.결과발현,후선서렬gpm565a구유식물항성기인편마산물적고도보수결구역,이차여항성기인Xal상사성고、친연관계근,추측가능여항성기인Ht1유관.기타후선서렬유우불구유식물항성기인편마산물적고도보수결구역혹자상사성저,친연관계원등원인,불능학정여항성기인Ht1유관.통과대후선서렬gpm565a진행이급결구급삼유결구분석,발현유대량구성단백질특이공능결구조건적무규칙권곡존재,추측gpm565a가능시Ht1공능역적일부분.
